如题，听说生物脱坑就是生信和生物医疗工程，找了一个网上咨询老师，他说这两个都比生物好，但是还是差不多，需求量不大，请问大佬们有没有好的建议啊

吧友里的大佬们，跟大家请教一个问题哇:我的一个基因(CDS序列）在人家的一个RNA转录组原始数据里Blast结果是这样的是说明什么问题啊？这个基因就中间这点儿表达了嘛？

我考上了一个二本的生信但是听说这专业就业竞争力特别大我在犹豫复读还是继续读我现在怕学了很久最后找不到工作学长学姐们给点建议

申请人：@光热生物 申请感言：您好！我对生物信息学充满热情，拥有丰富的学术与实践经验。我申请吧主，旨在促进学术交流，优化贴吧内容，增强社区凝聚力。我将致力于组织学术分享，鼓励原创内容，建立高效互动机制，确保信息准确有价值。同时，关注国际前沿，拓展国际视野。我承诺投入时间与精力，公正、公平地管理贴吧，倾听每位吧友的声音。期待与大家共同努力，将生物信息学吧打造为领先的学术交流平台。谢谢！

我目前正在做针对特定靶点设计特异性CIS，现在需要筛出一个或多个LIHC特异表达普通肝里没表达的膜蛋白，我应该用什么工具来筛，本人对生信不是很了解

输入示例：SYAP1 LUAD MKI67（SYAP1、MKI67为基因名称；LUAD为肿瘤名。） Example：SYAP1 LUAD MKI67（SYAP1&MKI67 refer to gene name；LUAD refers to cancer name.） 设计此模块的初衷：同时关注2个基因，验证这2个基因是否在一个信号轴上，或者2个基因可能存在潜在的联系，或者观察自己研究的基因是否与明星通路里的关键蛋白存在关系或挂钩明星通路。 Module designed for：Focus on two genes at the same time to verify whether the two genes are on a signaling axis, or whether the two genes may have potential

输入示例：MKI67 LUAD（MKI67为基因名称；LUAD为肿瘤名。） Example：MKI67 LUAD（MKI67 refers to gene name；LUAD refers to cancer name.） Figure：限制性三次样条法探索基因对4个生存期（OS，DSS，PFI，DFI）的风险是否为非线性 Figure：The restricted cubic spline method explores whether the risk of the gene for four lifetimes (OS, DSS, PFI, DFI) is non-linear. 说明：采用限制三次样条法进行分析，采用多事件Cox比例风险回归的风险比和95%置信区间。选取MKI67的中位数作为参考。浅红色区域为MKI67表达浓度

输入示例：CDC20 LIHC（CDC20为基因名称；LIHC为肿瘤名。） Example：CDC20 LIHC（CDC20 refers to gene name；LIHC refers to cancer name.） 目前已处理肿瘤： 乳腺导管癌 胶质母细胞瘤 胶质母细胞瘤 头颈部鳞癌 肾透明细胞癌 肝细胞癌 肺腺癌 前列腺癌 Data of following cancers have been processed： BRCA COAD GBM HNSC KIRC LIHC LUAD PRAD 背景知识：Cox回归模型，又称“比例风险回归模型(proportional hazards model，简称Cox模型)”，以生存结局和生存时间为因变量，可同时分析众多因素对生存期的

输入示例：MKI67 LUAD（MKI67为基因名称；LUAD为肿瘤名。） Example：MKI67 LUAD（MKI67 refers to gene name；LUAD refers to cancer name.） 目前已处理肿瘤： 头颈部鳞癌 HNSC 肝细胞癌 LIHC 肺腺癌 LUAD 肾透明细胞癌 KIRC 皮肤黑色素瘤 SKCM 胃腺癌 STAD 宫颈癌 CESC 低级别脑胶质瘤 LGG (在CGGA中WHO II和III，其中CGGA301队列去除了与CGGA693队列重叠的样本) 胶质母细胞瘤 GBM (在CGGA中WHO IV，其中CGGA301队列去除了与CGGA693队列重叠的样本) 膀胱癌 BLCA 结肠癌 COAD 直肠癌 READ 结直肠癌 CRC Data of

输入示例：MKI67 LUAD（MKI67为基因名称；LUAD为肿瘤名。） Example：MKI67 LUAD（MKI67 refers to gene name；LUAD refers to cancer name.） 图示：4个生存期（OS,DSS,PFI和DFI）的单因素cox生存分析的meta分析 Figure：A meta-analysis of univariate cox survival analysis for 4 survival periods (OS,DSS,PFI, and DFI) 说明：生存风险比Meta分析。Meta分析中，HR（风险比例）的标准误差使用95%CI（置信区间）计算。 Description：Meta-analysis of survival hazard ratio. In the meta-analysis, the standard error of HR (hazard ratio) is calcula

输入示例：MKI67 LUAD（MKI67为基因名称；LUAD为肿瘤名。） Example：MKI67 LUAD（MKI67 refers to gene name；LUAD refers to cancer name.） 图示：表达与生存状态曲线图 Figure：Graph of expression and survival states 说明：上方部分，y轴代表基因的表达量，曲线是基因表达由低到高的样本，蓝色代表低表达组，红色代表高表达组。下方部分，y轴代表总生存期，每个散点代表一个患者，蓝色代表患者存活，红色代表患者死亡。 Description：In the upper part, the Y-axis represents gene expression, a

输入示例：MKI67 LUAD（MKI67为基因名称；LUAD为肿瘤名。） Example：MKI67 LUAD（MKI67 refers to gene name；LUAD refers to cancer name.） 背景知识： 总体生存期： 统计患者的死亡时间（死于当前疾病或其他任何原因）。即患者从首次诊断为肿瘤到患者的死亡时间。当患者的总生存期提高，即患者获益。 优缺点：有利于随访的便利性，但随访时间较长。若大量样本并非死于目标疾病，真实性将下降。 疾病特异性生存期： 统计患者是否由目标疾病造成的死亡（死亡时间

输入示例：MKI67 LUAD hsa-miR-664a-5p（MKI67为基因名称；LUAD为肿瘤名，hsa-miR-664a-5p为miRNA名称。） Example：MKI67 LUAD（MKI67 refers to gene name；LUAD refers to cancer name, hsa-miR-664a-5p refers to miRNA name.） 背景知识1：miRNA（microRNA）通过一系列复杂的机制来影响蛋白质的表达。首先，miRNA是一类短链非编码RNA，可以通过与mRNA的互补配对来发挥作用。当miRNA与mRNA完全互补配对时，它会引导RISC（RNA诱导靶向RNA酶复合物）介导的降解途径，导致mRNA的降解，从而丧失靶标基因的功

输入示例：PDCD1 SKCM CD274（PDCD1、CD274为基因名称；SKCM为肿瘤名。） Example：PDCD1 SKCM CD274（MKI67&CD274 refer to gene names；SKCM refers to cancer name.） 图示：相关性分析与费歇尔精确检验 Figure：Correlation analysis and Fisher's exact test 说明：根据表达量将基因分成4类（Positive，Moderate，Weak，Negative），用列联表热图可视化，颜色的深浅代表样本数量的多少。对角线颜色越深，则2个基因的表达趋势具有较好的相关性，即相关性系数的绝对值更大。 Description：Genes are

输入示例：MKI67 LUAD（MKI67为基因名称；LUAD为肿瘤名。） Example：MKI67 LUAD（MKI67 refers to gene name；LUAD refers to cancer name.） 如下22个肿瘤有第一次治疗结局：ACC BLCA CESC COAD DLBC ESCA HNSC KICH KIRC KIRP LGG LUAD LUSC OV PAAD PCPG PRAD READ STAD TGCT UCEC UCS Twenty-two cancers have the treatment outcome during the first treatment course：ACC BLCA CESC COAD DLBC ESCA HNSC KICH KIRC KIRP LGG LUAD LUSC OV PAAD PCPG PRAD READ STAD TGCT UCEC UCS 图示：基因在第一疗程治疗结局的表达差异 Figure：Differential gene expression at the end o

输入示例：MKI67 LUAD（MKI67为基因名称；LUAD为肿瘤名。） Example：MKI67 LUAD（MKI67 refers to gene name；LUAD refers to cancer name.） 输出结果1：在肿瘤中，输入的目标基因与每一个基因的Pearson相关性（相关性系数的绝对值>0.7） 输出结果2：在肿瘤中，输入的目标基因与每一个miRNA的Pearson相关性（相关性系数的绝对值大于0.3） Output Result1：In the tumor, the Pearson correlation between the input target gene and each gene (absolute value of correlation coefficient >0.7) Output Result2：In the tumor, t

输入示例：MKI67 LUAD（MKI67为基因名称；LUAD为肿瘤名。） Example：MKI67 LUAD（MKI67 refers to gene name；LUAD refers to cancer name.） 目前已处理肿瘤： 乳腺导管癌BRCA 胶质母细胞瘤COAD 胶质母细胞瘤GBM 头颈部鳞癌HNSC 肾透明细胞癌KIRC 肝细胞癌LIHC 肺腺癌LUAD 前列腺癌PRAD Data of following cancers have been processed： BRCA COAD GBM HNSC KIRC LIHC LUAD PRAD 背景知识：卡方独立性检验：用于≥2个因素多项分类的计数资料分析，即研究两类变量之间（以列联表形式呈现）的关联性和依存性

输入示例：MKI67 BRCA（MKI67为基因名称；BRCA为肿瘤名。） Example：MKI67 BRCA（MKI67 refers to gene name；BRCA refers to cancer name.） 背景知识： The Immune Landscape of Cancer这项研究对TCGA上包括33种不同癌症类型的超过1万个肿瘤样本进行了大范围免疫基因组分析。在跨肿瘤类别研究中，研究者确定了6种免疫亚型。这种分型是通过巨噬细胞或者淋巴细胞标记物、Th1对Th2细胞比例、肿瘤间遗传异质性范围、异倍体性、新抗原负荷范围、总细胞图谱、免疫调节基因表达以及预

输入示例：MKI67（MKI67为基因名称） Example：MKI67（MKI67 refers to gene name） 图示： 基于HPA数据，展示目标基因在各个组织中的表达情况 Figure： Based on the HPA data, how the target gene is expressed in each tissue is shown. 说明： 纵坐标为不同的组织，横坐标为基因表达量（nTPM），棒棒糖图散点的位置为不同组织的基因表达量 Description：The ordinate represents tissue type, the abscissa represents gene expression level (nTPM). Scatter spots represent gene expression levels of various tissues. 方法：根据HPA和G

输入示例：MKI67 LUAD（MKI67为基因名称；LUAD为肿瘤名。） Example：MKI67 LUAD（MKI67 refers to gene name；LUAD refers to cancer name.） 图示：基因在高分期与低分期表达差异 Figure：Differential expression of the gene at different stages. 说明：TCGA-LUAD队列中基因在高分期与低分期的表达差异。 方框的上端和下端表示值的四分位数范围。方框中的线表示中值。 Wilcoxon Rank Sum Tests比较两组之间的表达量统计学差异。 Description：Differences in gene expression between high stage and low stage in TCGA-LUAD

输入示例：MKI67 UCEC（MKI67为基因名称；UCEC为肿瘤名。） Example：MKI67 UCEC（MKI67 refers to gene name；UCEC refers to cancer name.） 仅如下肿瘤有Grade分期：BLCA CESC CHOL ESCA HNSC KIRC LGG LIHC OV PAAD STAD UCEC Only the following tumors have Grade stages：BLCA CESC CHOL ESCA HNSC KIRC LGG LIHC OV PAAD STAD UCEC 图示：基因在高/低分级表达差异 Figure：Different gene expressions in high/low grades 说明：TCGA-UCEC队列中基因在高/低肿瘤等级的表达差异。 方框的上端和下端表示值的四分位数范围。方框中的线表示

输入示例：MKI67 LUAD（MKI67为基因名称；LUAD为肿瘤名。） Example：MKI67 LUAD（MKI67 refers to gene name；LUAD refers to cancer name.） 目前外部验证已开发以下肿瘤（数据集），有感兴趣的数据集可私信bioinformaticsboy： ACC: GSE143383 BRCA: GSE22820 COAD: GSE37182 GBM: GSE108474 GSE7696 GSE15824 GSE16011 GSE61335GPL19180 GSE61335GPL19184 HNSC: GSE30784 LIHC: GSE39791 GSE112790 GSE113996 LUAD: GSE31547 GSE40791 LUSC: GSE21933 GSE33479 PAAD: GSE62452 GSE28735 PRAD: GSE14206 GSE46602 STAD: GSE19826 GSE54129 UCEC: GSE17025 Currently, external validati

输入示例：MKI67 LUAD（MKI67为基因名称；LUAD为肿瘤名。） Example：MKI67 LUAD（MKI67 refers to gene name；LUAD refers to cancer name.） 图示：ROC评估基因表达对肿瘤组与正常组的诊断效能(TCGA联合GTEx分析) Figure：ROC shows the prediction efficacy of the gene on tumor/normal group (TCGA-GTEx analysis) 说明：TCGA-LUAD联合GTEx正常组织数据集中MKI67的ROC分析。MKI67的AUC值为0.904，95%置信区间为0.883-0.923。x轴：FPR，假阳性率；y轴：TPR，真阳性率。 Description：ROC analysis of MKI67 in TCGA-LUAD combined with norma

输入示例：MKI67 LUAD（MKI67为基因名称；LUAD为肿瘤名。） Example：MKI67 LUAD（MKI67 refers to gene name；LUAD refers to cancer name.） 图示： ROC评估基因表达对肿瘤组与正常组的诊断效能 Figure： ROC curves evaluate the diagnosis performance of gene expression on tumor/normal groups 说明：TCGA-LUAD数据集中MKI67的ROC分析。MKI67的AUC值为0.958，95%置信区间为0.936-0.976。x轴：FPR，假阳性率；y轴：TPR，真阳性率。 Description：ROC analysis of MKI67 in TCGA-LUAD dataset. The AUC value of MKI67 is 0.958 and the 95% confidenc

输入示例：MKI67 COAD 0.3（MKI67为基因名称；COAD为肿瘤名（结肠腺癌）；0.3代表将MKI67表达最高的30%的样本对比MKI67表达最低的30%的样本执行后续分析，如想采用中位值分析，则只需将0.3改为0.5。） Example：MKI67 COAD 0.3（MKI67 refers to gene name；COAD refers to cancer name；0.3 means that the 30% of samples with the highest MKI67 expression are compared to the 30% of samples with the lowest MKI67 expression for subsequent analysis, and if you want to choose the median as the parameter, 0.5 should be input.） 背景知识：对

输入示例：P46013（提示：P46013为基因的UniProtKB/Swiss-Prot，用户需到GeneCard数据库查询 (GeneCard)） Example：P46013 (Note, P46013 refers to UniProtKB/Swiss-Prot of your interested gene, which can be found in the GeneCard database (GeneCard)) 图示：下图为GeneCard数据库查询界面截图，红色方框圈出UniProtKB/Swiss-Prot，请复制到左侧数据框中进行分析。 Figure：The following image is a screenshot of the query interface of the GeneCard database. UniProtKB/Swiss-Prot is circled in the red box. Please copy it to the left data box for analysis

学长学姐们我是辽宁今年刚高考完成绩不太理想473排6.6w对这个专业有点感兴趣这个专业适不适合二本学生将来好就业么

本人211在读研二 已经通过自学完成一篇一区sci 致力于生信多组学分析 主要是通过宏基因组和转录组联合分析研究肠道微生物与宿主相互作用我这边有很多资料 可以一起学习哟#生信##生物信息##R语言##多组学##生信分析#

生信答疑辅导专注于生信分析，主要服务以下方面:一，TCGA\GEO\UCSC数据库数据挖掘。二、多数据集合并、差异分析、Cor相关性分析、 cox生存分析、GO富集分析、GSEA富集分析、 KEGG分析、LASSO回归分析、ssGSEA分析、免疫浸润、无监督聚类、药物敏感性预测、ceRNA网络、靶基因预测、临床模型构建、列线图绘制。三、数据可视化:热图，聚类，PCA，相关性， Venn，森林图，boxplot图，火山图等各类绘图和可视化。四、SCI全套分析、复现，肿瘤非肿瘤分析，单基

有偿求2ndFind使用方法，各种学习资料

有没有懂环境病毒的大佬呀，课题组有一个好几年前的湖泊数据包，以前已经把病毒多样性什么的都探索了，现在老板想让我们再翻点新的东西出来，有没有大佬能提供一点思路，谢谢了

本人本科大二农学专业，想跨考生信，最好是动植物生信，想了解一下，有没有佬讲一下从哪开始学和推荐一下学校？

今年高考，华中农业大学的生物信息学怎么样，报的话应该是稳稳的能上，这个学校这个专业怎么样，考研好不好考

本人农业大学生信专业，想考研，不知道什么专业更适合生信，求解答，万分感谢！！

请问一下各位：我对自己测的二代全基因组进行MLST分型时，有很多都有2、3个ST型，请问这种大家遇到过这种情况吗吗？我应该怎么确定他唯一的ST型呢？

12345

本人大三，对生物信息学感兴趣，想考研，有没有志同道合的伙伴，一起学啊！目前是小白一个

高考大概500左右，想学生物信息有什么建议

黑龙江10400排名，想去哈医大，但是生物信息学是5年学制，我看其他学晓都是4年，有什么区别吗，还是发的学位证书不一样？

我有一个数据集，里面有LOC、RGD、MGC编号的基因，进行DAVID富集时，选择Official Gene Symbol，物种是大鼠，不能成功，但是我删除LOC或RGD其中一个就可以富集成功，现在我把RGD编号的基因通过数据库转换为LOC编号的基因，又不能成功，是原因啊？给的提示是You are either not sure which identifier type your list contains, or less than 80% of your list has mapped to your chosen identifier type.有懂的吗？

有人能帮我解决转录组比对hisat2的一些问题嘛，有偿

计算机辅助药物设计的药效团模型构建里的基于配体的构建，课本里筛选出了3个，但我只有两个，明明是跟着课本做的(╥╯﹏╰╥)ง #生物信息##计算机辅助药物设计##药效团模型#

fasta文件用repeatmasker硬屏蔽后，重复序列成了N，用包含N的fasta文件进行blastn，会有影响么