第一种可能：鳄龟

鳄龟那霸气的外形及蛇形的尾巴让人觉得它就是一个活脱脱的“在世玄武”。
让我们来看看它们的对比图：

我们可以看到玄武与鳄龟之间相似性还是很大的。

（鳄龟，是现存最古老的爬行动物，世界最大的淡水龟之一 ，主要分布于北美洲和中美洲 。）
在古代中国并没有鳄龟存在，但是由于各种不确定因素鳄龟也是有可能出现在古代中国，由于对未知事物的好奇而被人们神化，再加上蛇形的尾巴故而有了龟蛇组合而成玄武的说法。
【这个看法有个致命的缺漏，我一开始却没有想到，后由秦晋唐明提醒楼主才意识到错误所在：我们接触最多的玄武形象都是现代画家所画，可是古代玄武形象却与鳄龟毫不搭干，所以玄武原型为鳄龟的可能性下降一大截。】
补充古代玄武原型图：

第二种可能：长颈龟。


脖子的长度很符合玄武龟壳蛇身的标准，故列入可能性榜单。
（长颈龟是龟鳖目蛇颈龟科长颈龟属的1种 。又名蛇颈龟，分布于澳大利亚东部）

第三种可能：蛇颈龙


这种可能性会比前两种可能性小很多，因为蛇颈龙毕竟是灭绝了的生物（但不排除个体幸存繁衍至今）
也许在古代有幸存的蛇颈龙被村民在水上目击（可以想象一下，目击者由于精神高度紧张，再加上蛇颈龙的外貌的确很像龟壳蛇身）于是一传百，百传千，千传万，渐渐演化成神兽玄武的样子。

第四种可能：黄缘闭壳龟（黄缘盒龟）
首先感谢秦晋唐明的补充。
下面引用秦晋唐明的看法：
“它的腹部的甲可以向背甲完全闭合，将头尾包住。甲片闭合的时候腹部会出现一个缝隙，如果有东西进入这个缝隙，会被它紧紧夹住。 南方人见过它用这种办法猎杀活蛇，所以给它起名克蛇龟。也许有不识野物的文人见了龟蛇相斗，以为神异，记入书中。”
黄缘闭壳龟，龟科、盒龟属。主要分布在中国南部、日本等地区，分布广泛。

第五种可能：草龟（由秦晋唐明补充）
中华草龟华草龟(Chincmysreevesii)俗称乌龟、金龟，属龟鳖目、龟科。李时珍说过这么一句话：“介虫三百六十， 而龟为长龟，介虫之灵长者也。” 在国际市场上，中华草龟也十分畅销。日本、菲律宾以及欧美各国人民将其视为象征“吉祥，延年益寿”之物。

墨化草龟更接近玄武形象：

第六种可能：某种龟蛇之间保持共生关系，被古人误解为神明。（由无奈之伤补充）
下面引用无奈之伤的看法：“会不会是某种已经灭绝的龟？这种龟会跟蛇保持共生关系，就像鳄鱼跟鸟那样？”
众所周知，两种生物共生一定是为了生存互惠互利，可是龟蛇之间貌似并没有什么好合作的，相反还互相捕食，这是这种观点的不足之处。
【完】

我喜欢这些动物

玄武的原型是凹甲陆龟 谢谢 不用猜想