子午流注针法是一门古老的针灸方法，堪称国医绝学，为开启人体经络的金鈅匙。子午流注针法，起源历史悠久，源远流长，其理论体系朔源于《内经》。如《素问，六节脏象论》天以六六为节，地以九九制会；天有十日，日六竟而周甲，甲六复而终岁，三百六十日法也。《素问，六微旨大论》‘天气始于甲，底气始于子，子甲相合，命曰岁立，谨候其气’。《灵枢，岁露论篇》‘人与天地相参也，与日月相应也’等等。又有《难经》六十四难等对五输分属五行极其意义等都作了分析说明，并对十天干运用作了概括性的阐述。
子午流注成书为宋朝或更早晋朝，皇甫士安著《针灸甲乙经》，金、元时期更为盛行，南塘，何若愚撰写，《子午流注针经》，窦汉卿提倡八法流注，按时治疗，著《有标幽赋》、《通玄指要赋》。到了明代更是得到了诸多名家的研究与重视，如；李挺、徐枫、杨继洲、高武等，特别是许枫所著《针灸大全》记载了子午流注逐日按时定穴歌十首，后世应用子午流注针法均以此为依据。
由于子午流注针法的应用，较难于一般的取穴法，加之后人缺乏研究，更兼“针刺，艾灸，究非奉君之所依，因而至清代以后，针灸每况日下，几乎无人应用子午流注针法，甚至使古法失传。
解放后，在中国共产党的正确领导下 ，在党的中医整车感召下，在中医前辈积极发掘整理下，致使古老而神奇的子午流注针法再现人间，为人类的健康事业服务。可遗憾的是古老而神奇的子午流注针法，较难于掌握，而未得到普及与推广。