Pixelmon入门
随着Pixelmon成功安装跟载入，美丽的minecraft世界将会出现在你的眼前,口袋妖怪们会活跃在巍峨的高山，广袤的草原，清澈的小河，深邃的大海，辽阔的蓝天。首先，一个启动页面会出现在你的眼前，让你去选择你的御三家精灵！感谢上帝，在Pixlemon里不会有长得奇奇怪怪的博士给我们赠送精灵。（大木空木小田卷莫名其妙就被黑了= =）
选择之后，你所选择的精灵的基本信息会出现在屏幕的左边。按下按键“O”可以调整左边精灵信息栏的大小。
现在对准一个方向，按下按键“R”，精灵就会被丢在你面前啦！睁大眼看看那萌萌哒精灵吧，放出的精灵的不一定非得是在你屏幕左边队伍的首位，如果你有超过一个精灵，按下“【”跟“】”键可以上下选中左边信息栏的精灵。
无论怎样，现在让我们开始对战吧！口袋妖怪的终极乐趣就是对战！想找一个精灵或者训练师来进行对战很简单——对准精灵然后投掷出精灵球，让你的精灵砸在对方身上。听起来很简单？嘿嘿，当你想把球投掷在一只逃跑的小拉达身上时你就不会这么想了，但是不久后你肯定会享受这种乐趣的。
开始战斗咯！当你看到对战页面时，你一定会惊异：玛德怎么跟原版口袋妖怪对战页面一模一样！这太尼玛吊了！ Pixelmon跟原版游戏一样，会在对战中给予你四个选择：对战，背包，换下精灵，逃跑。选择对战的话就会给你技能供你选择使用，嗯，差不多就这样了。

按键控制
Pixelmon的键位可以在游戏中的按键设置中更改。

Pixelmon预设键位
· R: 放出/收回精灵
· ↑ & ↓:上下选择GUI界面中的精灵
· O:显示/隐藏GUI界面中的精灵队伍
· 右键: 显示精灵菜单（对着精灵图标）/给精灵使用东西（在背包界面）
· F:如果你要放出你的一只精灵，当你的光标对准某只野生精灵时按下这个键即可锁定对方，然后放出精灵即可与之发生对战
· G：使用指定的对战外技能
· B:如果某只精灵学会了多个对战外技能，则此键可以循环选择
· I:如果玩家正在注视一只精灵，这个键可以打开精灵图鉴。除此之外，如果玩家手持一件物品，这个键会在浏览器中打开Pixelmon维基或我的世界维基中关于这个物品的页面。如果玩家只是注视着一个方块而没有做上述的两件事情，则这个键可以打开关于这个方块的Pixelmon维基页面

骑乘控制
根据配置文件"Enable point to steer" 这一项的允许与否（默认为允许），骑乘控制被分为两种。骑乘控制是以我的世界的基本动作控制为基础的，所以会随着我的世界本身的动作键位设置改变而改变。

Enable point to steer允许
· W: 向前走
· S: 向后走
· 移动鼠标: 左转/右转
· 空格键: 跳跃
· 左shift键/对精灵右键：解除骑乘

Enable point to steer不允许
· W: 向前走
· S: 向后走
· A: 向左转
· D: 向右转
· 空格键: 跳跃
· C:下降（飞行时）
· 左shift键/对精灵右键：解除骑乘

治疗你的精灵
当精灵对战之后HP会受到损耗，给精灵治疗是一个训练师当仁不让的。想给精灵治疗，你需要一个治疗机或者仅仅是一张床而已。床只能在晚上睡觉时使用，所以治疗机更划得来。跟精灵电脑一样，治疗机同样也存在于随机分布的精灵中心里，或者你可以通过以下合成公式来合成：

当治疗机制作完成后，放置在地面上，然后对其右键，你的精灵球就会自动放置到上面，治疗过程完成后精灵球又会返回到你的身上。

当你制作好一个化石清洗机后，请放置到地上。然后拿着化石对其右键。化石清洗机会拿走你手上的化石，接着你会看到化石清洗机自转很多次。等待几分钟，直到它自己停下来。然后右键拿下清洗完毕的化石。
当你把化石清洗干净后，就可以开始准备把它变成精灵了！在这之前，你需要一个化石机：
化石机四个配件合成公式：

当你制作好化石机后，拿着化石对其右键即可放上化石，然后机器会开始帮你把化石转换成精灵。你可以看到化石会在上面一点点发生变化，当屏幕上显示进度达到100%时，会提示你放进一个精灵球。照它说的做，在手上拿一个精灵球然后对其右键。然后化石机会拿走你的精灵球，接下来它会让你再拿走精灵球。照做，对其右键即可拿走你刚才放置的精灵球，现在化石精灵就已经被装在球里了，你可以像其他精灵一样自由操纵化石精灵去战斗。
注意：如果你碰巧找到了一个树根化石，先保存起来，因为触手百合（树根化石复原而来的精灵）还没被加入到Pixlemon里。

化石：

化石矿可以在沙砾中被找到。
化石是一种包含了亿万年前的远古精灵的DNA的石头。可以在高度为12-50的沙砾层中被发掘。化石的生成率不算太高，所以要找到它们可能会花费一点时间。跟沙砾不同，化石矿不会受到重力的影响。
当你将它挖下来后，化石矿会随机产生一种除了树根化石以外的布满灰层的化石，这是因为触手百合在目前的版本中还未被加入。挖下来的布满灰层的化石可以在化石清洗机清洗，只需手持化石然后对其右键。

化石种类
一旦布满灰尘的化石被清洗干净后，就可以得到以下九种化石之一了。它们包括：
· 贝之化石 (菊石兽)
· 龟壳化石 (化石盔)
· 神秘琥珀 (化石翼龙)
· 树根化石 (摇篮百合)未被加入
· 尖爪化石 (太古羽虫)
· 头盖化石 (头盖龙)
· 盾牌化石 (盾甲龙)
· 盖状化石 (原盖海龟)
· 羽之化石 (始祖小鸟)

化石精灵
将化石放入到化石机后，化石精灵复原程序就会启动，等待完成还需要等待几分钟。复原而来的精灵种类严格按照化石种类来，当复原完成后，你需要在化石机放上任意一种精灵球来收服化石精灵，复原而来的精灵会变成1级。

未实现的部分
· 树根化石在化石机中不能被复原，这是因为触手百合跟摇篮百合还未被加入到mod中。

生成精灵指令
你是不是有时候会觉得寻找传说精灵太麻烦，想直接召唤一只出来，却不知道怎么做？没关系，其实很简单。只需要打上指令：“/pokespawn 你想召唤的精灵英文名lvl你设定的精灵等级” 你想召唤的精灵就会生成在你附近了。这个指令可以在单机的作弊条件下使用，也可以在多人服务器里使用，当然，除非你有这个权限。