东吴优越的地理条件使其可以组建当时最强大的水军。《三国会要》记载船战令曰：“ 雷鼓一通，吏士皆严；再通，什伍皆就船。整持橹棹，战士各持兵器就船，各当其所。幢幡旗鼓，各随将所载船。鼓三通鸣，大小战船以次发，左不得至有，右不得至左，前后不得易。违令者斩。”东吴水军战船主要大船有楼船、斗舰、小船有走舸、蒙冲等，能出海者为海船。孙权曾派“将军卫温、诸葛直将甲士万人浮海求夷洲及亶洲。”东吴舰船数量众多，《三国志·贺齐传》记载：“蒙冲斗舰之属，望之若山。”楼船是大型战舰上建三重楼，最大建有五重楼。贺齐所乘船雕刻丹镂，青盖绛襜，《江表传》记载：“吴楼船之有名者，皆雕镂彩画，”孙权乘坐的楼船有“飞云”号、“盖海”号。《吴都赋》就记载：“弘舸连轴，巨槛接舰，飞云盖海，制非常模。”还有一艘大船名曰“长安”亦曰“大舶”，载坐直之士三千人。当时东吴出使句骊，使者谢宏的船小只能“载马八十匹而还。”东吴所谓的小船都能装载八十匹马，可见东吴水师的强大。
斗舰
防御型战舰，以桨为动力，船头立有旌旗及指挥进退用的金鼓等，船身两侧有插桨用的孔，船上建有带箭孔的女墙，墙内布置士兵，可以对敌船进行射击。女墙的高度可以遮挡士兵半身。主要起防御作用。斗舰主要用于指挥，是整个舰队的旗舰。
楼船
体型极其庞大，春秋战国时期的吴国和越国就已经能够建造楼船，吴王阖闾乘坐的“余皇号”就是楼船。汉武帝征伐南越时期建造的楼船已经可以搭乘1000人，高度越为28米，是今天好几层楼那么高。甚至传说汉武帝曾经造过一艘巨无霸级大船，号为“豫章大船”，可乘万人，穿上可以建造宫殿，当然这不可能是战舰了。三国时期吴国建造的用于作战的楼船则更加庞大，船上能够建造5层楼，最多搭乘3000人，是水战的主力。通常的战术是撞击敌船或直接登上敌船进行肉搏。因此船只的大小直接影响搭载士兵的数量，也就直接影响战斗的结果。东吴的楼船上除了建有高楼外，每层楼上也建有防御性的女墙，第一层女墙上还有剑孔、矛孔等，既可远攻，又可近防，还设有礌石、铁刺等防御性武器。《太平御览》记载东吴有名号的楼船包括：飞云、盖海、长安、赤龙、驰马、青龙战舰、晨凫等等。
艨艟
主要用于突击的战舰，体型细长，以生牛皮覆盖船身，防御性较好，船身设有箭窗、矛孔，可以近距离攻击敌军。但艨艟最主要的特点是船头有坚硬的尖刺形状突出物，用于冲撞敌船，由于其体型狭长，因此行进速度极快，这种冲击力极强的战舰通常会给敌军造成突如其来的打击。周瑜在赤壁火攻曹操水军大营时用的就是这种艨艟搭载火具，致使大胜。
东吴水军除了设备先进外，技术上的优势也很明显，其中最主要的特点是此时船尾舵的出现。总结相关史料可知，三国时代的东吴已经发明船尾舵，这种装置可以很好的控制船只行进方向，使船只的灵活度极其精确，而西方国家最早要到13世纪初才出现船尾舵。东吴水军的这种技术优势使其受恶劣天气的影响程度降低，即便水面风向不利，也可通过船舵最大限度的控制行进方向。
另一技术优势是东吴时期双桅战船的出现。在风向利于己方时，双桅战舰能够提高行进速度，在以船只撞击为主要作战方式的水战中，速度快就意味着冲击力强，加上东吴水军强大的战舰，用一波进攻就使敌船丧失作战能力是完全可以做到的。
当然，东吴水军的技术上也有劣势，如楼船由于重心问题，导致抗风能力差，只能用于内陆河流湖泊，出海的风险极高，容易沉没。其中比较著名的是吴将董袭指挥的“五楼船”在长江水面上遭遇大风，结果颠覆，董袭溺水而亡；另外，孙权的“长安号”楼船也是在大海上遭遇暴风而沉没的。 东吴降晋时有兵二十三万，舟船五千余艘，吏三万二千，最强盛时有兵近三十万。