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Avizo工作流程说明及实例演示
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Avizo工作流程说明及实例演示
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1楼
2016-02-02 10:03
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截取Avizo产品手册中一个处理流程示意图:
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2楼
2016-02-02 10:05
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2楼中右上角是数据来源,可以是
· X射线断层,CT, 微米\纳米CT,同步加速器
· 显微镜:电子与光学
· 其他采集技术(MRI,射线等)
通过这些设备获得的二维切片数据将作为Avizo的导入数据,之后我们就可以开始数据预处理,分割,三维重构等操作。
稍后我会逐步解释每个环节,之后再通过一个实例做演示。
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3楼
2016-02-02 10:10
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数据采集:
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4楼
2016-02-02 10:14
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数据过滤、预处理,其实就是用各种过滤算法对源数据进一步处理,以便于之后的数据分割。
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5楼
2016-02-02 10:18
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针对上一步的数据过滤处理,我的经验是好的采集数据有些情况下都不需要这一步,直接渲染或分割。
针对数据采集,Avizo里这么一句话拿来与大家分享:
“Also keep in mind that improving image acquisition might be much easier than analyzing bad images."
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6楼
2016-02-02 10:38
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数据处理之后,下一步就是可视化与探索,其实就是基于灰度值,进行渲染,我们常用的就是Volume Rendering,之前看有些朋友反馈Volume Rendering之后无反应,这应该是显卡的问题,集成显卡无法使用这个功能。
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7楼
2016-02-02 10:42
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之后将是数据分割,数据分割是我们做图像处理的难点,分割是基于阈值进行的,专家们可以依据自己的经验来确定这些临界点,这也就说明分割其实没有一个标准。
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8楼
2016-02-02 10:47
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还可以制作视频,虽然大家论文中依然使用的是二维图片,但在项目研究报告过程中可以通过动画视频等方式更直观的展示研究成功。
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10楼
2016-02-02 16:17
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Avizo里还支持空隙网络模型的分析
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11楼
2016-02-02 16:18
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还可以进行网格化,导出进行3D打印,或者是导入到ABAQUS,ANSYS等工具进行有限元分析等。
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12楼
2016-02-02 16:20
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之后我们将通过一个简单的实例展示Avizo如何将数据导入,过滤,预处理,分割,定性定量分析,重构,动画制作等,下面是Avizo 9.0.1版本的启动界面:
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13楼
2016-02-02 16:26
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这里我们加载的数据是Avizo自带的一个Sample数据,格式已经被保存为*.am格式,其实就是一组29张切片数据。
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14楼
2016-02-02 16:33
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下面一步我们用了一个中值过滤法,Media Filter,并将过滤前后的数据做了对比展示,左侧是过滤前,右侧是过滤后:
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15楼
2016-02-02 16:37
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下一步我们进行二值化Interactive Thresholding分割:
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16楼
2016-02-02 16:39
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