循环的生命
●神星树原本有「sefiroth」和「qliphoth」两套生命的轮回系统，分别由拥有创造之力的「创星神sophia」和拥有破坏之力的「创星神tierra」掌控 。太古时期这俩进行了一场大战，「创星神sophia」战胜了「创星神tierra」，神星树的系统就完全委托给「创星神sophia」掌控。「创星神sophia」做出了可以同时执行创造之力和破坏之力、可以访问神星树的核石，并且用核石把「创星神tierra」封印在神星树里。之后「创星神sophia」将核石打碎使其不能再次使用，让其寄宿在居住在远离神星树的地方的生命里，之后变成了「宝石骑士」的“辉石”。藉由神星树被「创星神sophia」封印，从此大地变成了只有「创星神sophia」经手的生命才能在地上繁衍。「创星神tierra」却不甘就这样败北，为了夺回霸权长年累月在神星树里逐步干涉「创星神sophia」的「sefiroth」系统，把「sefiroth」里的生命能量变为「qliphoth」的生命能量。以「创星神sophia」与地上生命交战后战败为契机，「创星神tierra」开始制定自己的复苏计划，第一阶段就是用其神力再次启动神星树的「qliphoth」系统，第二阶段是入手十个“核石”，将抑制着自己的封印解开，而最后的阶段就是得到“创造之力”和“破坏之力”，达成完全的复活。

星震的前兆
●之前的大战里继承了「创星神sophia」的创造与破坏之力的「入魔 双蛇杖使」和「星圣 草帽星系」察觉到了各自拥有的“创造之力”和“破坏之力”受到了来自外部的干涉，他们怀疑这是「创星神sophia」复活的前兆，为了究明真相而外出查探，过了十年后在「自然的神星树」底下重逢。
同样察觉到异变的还有「自然狮面草」、「侵入魔人 蟑蠊」，以及之前的大战之后守护着大地的「影灵衣」和「灵兽」。「星圣 草帽星系」和「入魔 双蛇杖使」确信那种干涉是来自神星树，便将“创造之力”和“破坏之力”的一部分分别给予了「自然狮面草」和「侵入魔人 蟑蠊」，让他们成为守护神星树、排除威胁的战力。

大地的精灵龙「龙星」
●和「入魔 双蛇杖使」分别，飞离神星树的「星圣 草帽星系」为了让拯救星球危机的力量觉醒，开始前往分散在世界各地的生命能源强劲的地脉。拥有从「宝石骑士王 辉钻」那里继承的七个“辉石”加上它自己的前身「宝石骑士 炽金石」的“辉石”，合计8个辉石的「星圣 草帽星系」用“创造之力”使八只分别继承了1个“辉石”的「龙星」诞生。「星圣 草帽星系」的目的是，从大地上流动的源自「创星神sophia」的能源中使「龙星」具象化，解开「自然的神星树」的封印，进而访问「sefiroth」系统。那是为了控制「sefiroth」阻止「创星神sophia」复活。为了达成目的需要九只「龙星」，「星圣 草帽星系」为了令第九只「龙星」具象化不断在全世界寻找相应的新的地脉。
※具象化的八只「龙星」
「炎龙星-狻猊」「地龙星-狴犴」「水龙星-赑屃」「风龙星-蒲牢」
「幻龙星-嘲风」「魔龙星-饕餮」「宝龙星-负屃」「秘龙星-囚牛」
（最后两只现在还不是「质点」怪兽）

影依的觉醒
●过去的英雄「宝石骑士王 辉钻」的尸体复苏袭击世人，听说了这个传言的「入魔 双蛇杖使」前往霞之谷大湿地，发现昔日的战友已经堕落成「暗迁士 黑蛇晶」。「暗迁士 黑蛇晶」拥有吸收生者的灵魂，让肉体变为没有意志的空壳的可怕能力，为了不让牺牲者增加而孤军奋战的「入魔 双蛇杖使」在旧战友跟前没能发挥本来应有的力量，战败被吸收。吸收了「入魔 双蛇杖使」的「暗迁士 黑蛇晶」受到其持有的“破坏之力”的影响，变为「影依的原核」，生产出大量之前的大战里殒命的死者的大军——「影依」。「影依」本是死后应该通过「sefiroth」系统转生的生命，但是在神星树中轮回的时候它们的灵魂被「创星神tierra」捕捉被封在了「狱火机」的真空管里，令它们逐渐从「创星神sophia」的生命转化为「创星神tierra」的生命。那时候由于神星树系统的BUG令它们只有肉体在现实得到实体化，基本没有自我意识，但却一心想要再次转生为正常的生命体而想要回到神星树中去，因此「影依」大军们开始对神星树展开侵袭。透过“创造之力”得知了「入魔 双蛇杖使」的「星圣 草帽星系」为了阻止「影依」的侵略而带着八只「龙星」前往霞之谷大湿地，然而激斗中「炎龙星-狻猊」与「风龙星-蒲牢」的影子被夺走而影依化。剩下的「龙星」们虽然勇敢地迎战，但却被「影依」追赶至穷途末路。

连结星与大地之龙
●为了扭转战局，「星圣 草帽星系」集结了漂泊在天空的星星的能源，将与其他龙星相异的存在「光龙星-螭吻」具象化。「光龙星-螭吻」拥有与之前大战里「星圣」拥有的力量同质的“连结星之力”，它将这种力量解放，将包含已经被影依化的「龙星」在内的同伴们结合为一体，进化成了「辉龙星-蚣蝮」。

守护星球的战士
●为了响应「辉龙星-蚣蝮」的诞生，从天空的闪闪星光中有光之战士降临大地。他们是「星圣」的末裔们。结合了12位「星圣」的力量的「星圣 草帽星系」将寄宿在自己身上的十二星座的英雄的力量“12星环”交还给战士们。取回那个力量的光之战士们得到了“星因环”，化为守护星球的战士「星因士」，并加入与「影依」的大战。

照在影牢的星辉
●然而持续的交战中，八只「龙星」完全被影依化。拥有巨蛇座之力的「星因士 巨蛇座α」从被「影依」囚禁的影子中察觉到了和自己相近的力量——那是被吸进「影依的原核」中的「入魔 双蛇杖使」的“蛇夫座”的力量。虽然有尝试救出「入魔 双蛇杖使」，但影依的力量过于强大，「星因士 巨蛇座α」却反过来被拘束了。「入魔 双蛇杖使」感受到了「星因士 巨蛇座α」冒死的决意，从内部开始抵抗，然而被「影依的原核」抑制着“破坏之力”的它心有余而力不足，最后「星因士 巨蛇座α」被影子吸收而「影依」化，变成了「影依蜥蜴」。不过这时，「入魔 双蛇杖使」用尽最后的力量，将自己手持的杖的力量的一半从影子里分离了出去，将之托付给了在外界奋战中的「星因士」们。「星因士 天鹅座α」身上寄宿的杖之力将星因士的“连结星之力”增幅，与「星因士 天琴座α」以及「星因士 天鹰座α」一同进化成了「星因士 夏三角」。「星因士 夏三角」遵从「神星因子」的指引，继续从天空召唤出新的星因士。

堕入魔影的龙
●然而「星因士」没能计算到的一点，吸收了「星因士 巨蛇座α」的「影依」，也同样得到了“连结星之力”。「影依」驱使这种力量，将以及影依化的「水龙星-赑屃」与「影依蜥蜴」融合，成为了拥有“连结星之力”的黑暗龙星「暗龙星-椒图」，接着「暗龙星-椒图」再与影依化了的「魔龙星-饕餮」融合，成为了「邪龙星-睚眦」。至此战局由「星因士+龙星」vs「影依」变为了「星因士」vs「龙星+影依」。

●得到了“连结星之力”的影依继续将八只龙星体内寄宿的“辉石”，以及「神影依 拿非利」寄宿着的「宝石骑士 青金石」的“辉石”，向寄宿在「影依的原核」的「暗迁士 黑蛇晶」的“暗迁石”聚集，得到了合计十颗“核石”的「影依的原核」进化成了「神影依 神子晶」。「神影依 神子晶」在企图复活的「创星神tierra」的意志的操控下开始侵袭神星树。

星球守护者集结
●然而集结了「星因士 冬三角」与「星辉士 夏三角」两位「星辉士」的力量也未能撼动「神影依 神子晶」和「神影依 拿非利」，结果他们只好从大湿原撤退。一直后退到神星树前面的「星因士」们，借助为了守护神星树而集结在一起的「神树的守护兽-牙王」「励辉士 入魔蝇王」「灵兽」「影灵衣」，张开了围住神星树的结界，构筑最后的防卫线。

于神星树的决战
●联合军与「影依」开始围绕着结界展开激斗。在联合军的激斗外加互相配合的战术下，「影依」的军势被抑制住了。只要有联合军的抵抗在，结界就无法被突破，「创星神tierra」只能另生一计，寻找一位灵力强大到足以打破结界的个体使其影依化，它把目标定在了「灵兽使 温」身上，令其堕化为「神影依 温迪戈」。
※强大灵力的寄宿者
「灵兽使 温」出生便持有强大到令周围的人所畏惧的灵力，有着被自己双亲抛弃的过去。之后被「灵兽使的长老」收养，与「薰风的神裔 美利河」一起形同姐妹般长大。平时为了抑制自己讨厌的强大的灵力，而闭着眼睛。

神的假身
●得到了集结在神星树下的人们的帮助，「星因士」们成功让「神影依 神子晶」沉默了。然而此时，「神影依 温迪戈」按照「创星神tierra」的计划从内部将结界破坏，令「神影依 米德拉什」得以成功进入结界内部。「神影依 米德拉什」与神星树接触，利用自己身上的神之波动访问了神星树的制御系统，在「创星神tierra」的声音的引诱下将神星树里面的「qliphoth」系统启动了。
※神之波动的拥有者
生前的「神影依 米德拉什」是「薰风的巫女 薇因妲」，她在「创星神sophia」复活之时被卷入，身体承受了「创星神sophia」的神之波动而死亡。为了补完「创星神tierra」复活所需要的「创星神sophia」之力——访问神星树的权限，为此它有意令「薰风的巫女 薇因妲」作为「神影依 米德拉什」复活。

「机壳」启动
●神星树的地下，隐藏着「机壳」以及被封印着的「创星神tierra」的生命系统「qliphoth」。通过「神影依 米德拉什」的接触而解开了封印的神星树，将大地之楔拔出上浮到天空中。无论是「星因士」还是在神星树下集结的人们都没有办法能够阻止这次事态发生的如此巨大的变化。与此同时，本应已经沉默的「神影依 神子晶」的躯体开始发生变化。它身上寄宿的十颗核石上浮并被神星树吸入。被「qliphoth」系统吸收的十颗核石转化为「机壳」的动力核心，「机壳」由此启动了。

影缚的要塞
●开始行动的机壳并没有将地上的生物放在眼里，而是执拗地将目标固定在「影依」上，将其驱逐与拘束。机壳本身是制御寄宿于「自然的神星树」的「qliphoth」生命系统的均衡的存在。藉由「sefiroth」的生命系统诞生，但是只有灵魂被转化为「qliphoth」，用「sefiroth」系统的肉体活动的「影依」对「机壳」来说是应该排除的异端，是不能存在的生命。
纵使有压倒性的力量的「机壳」，「神影依 拿非利」也依然过于强大，「机壳」不得不与地上的人开始协作。将从内部抑制「影依」的「入魔 双蛇杖使」的力量与「星辉士 夏三角」从「入魔 双蛇杖使」继承的杖之力，集中在「隐藏的机壳杀手 物质主义」身上，结合自内而外的拘束力量后，总算将「神影依 拿非利」的行动停止了。但并不能称之为完全成功，担心拘束会解开的联合军在「入魔 双蛇杖使」的助言下，让「影灵衣的术士 施里特」将身上寄宿的冰结界三龙的力量用作封印，将「神影依 舍金纳迦」整个冰结起来封印了。