选择合适水泵的功率。选择水泵时需要考虑的因素有：鱼缸的大小、过滤的形式、滤材的丰富程度、养殖密度、鱼的个头大小、鱼的种类等。通常来说，鱼缸容量越大、滤材越少和简单、养殖密度越大、鱼的个头越大、 所养种类的鱼新陈代谢越快，则水泵的功率需要偏大些才适合。

根据缸的大小配置水泵。以常见的顶部水槽过滤的成品缸养殖中、大型鱼时， 每100升水的缸容量配置25瓦左右的水泵比较合适。例如，鱼缸鱼长度1.2米、宽0.35米、水位0.5米，那么鱼缸的水容量就是1.2*0.35*0.5*1000=210 (升)，则可考虑配备2个25瓦左右的泵，或配备45瓦左右的单泵（也可考虑分成2个出水口，一个直接在缸内造流，一个将水引入顶部的水槽过滤）。

养殖密度。目前市面所售的成品缸的配套水泵大多功率偏小且滤材简单，而且一般水泵都达不到它所标示的的额定功率和流量。新手养鱼时大多偏爱较大的养殖密度和喂食频次（希望鱼快点长大），结果发现鱼没养多久就开始生病死亡。很大原因是不明白养殖密度、种类、喂食频次需要与缸的大小、过滤系统的强弱相匹配。改善过滤系统的一个重要方法就是给你的鱼缸重新匹配合适的水泵。