慢性腹泻根据其原因有以下几种可能：
a. 由内分泌系统不正常造成，如：肠易激综合症；
b. 由长期缺乏维生素和矿物质等造成，主要可能缺硒、维生素A、维生素B12、维生素B9（即叶酸）、维生素D和钙等；
c. 由慢性炎症造成，如：湿热型慢性腹泻等；
d. 由免疫系统异常造成，即通常说的过敏症状。
因而，可以用如下一般方法治疗：
a. 如果明显怕冷，同时一吃生冷东西或中医上的凉性食品就腹泻，如：西瓜、梨、纯牛奶、哈密瓜、蜂蜜等，肠镜检查正常，属于肠易激综合症，服用布洛芬+补硒片即可，布洛芬每天2-4粒，补硒片按说明书服用。如果另外服用复合维生素B+钙片+维生素D，效果会更好一些。
b. 如果明显怕冷，但不属于肠易激，即吃生冷东西和凉性东西不一定马上腹泻，或只有早晨起来时吃这些东西会腹泻，平时不腹泻，每天腹泻次数在3次以下，肠镜检查没有红肿溃疡等炎症迹象，应当由长期缺乏维生素矿物质造成。治疗方法是：吃补硒片+维生素A+维生素B12+维生素B9，应当效果不错。这些病人通常有掉头发现象，或有五更泻（早晨一起来腹泻，平时不腹泻），怕冷非常明显。对于五更泻，如果补充维生素矿物质效果不够好，可以再少量服用四神丸。
c. 对于慢性炎症造成的慢性腹泻，服用大剂量谷维素，每天3次，每次5-10粒。注意这种病人应当肠镜检查有红肿、溃疡等症状，平时大便可能出血，即有脓血便的症状。
d. 对于免疫系统异常即过敏产生的慢性腹泻，服用氯雷他定，但临床中发现这类病人通常也有维生素矿物质缺乏现象，单独服用氯雷他定效果不够好。这时，病人也应当伴有怕冷现象，可以同时服用维生素A+维生素B12+维生素B9。
e. 还有一类病人属于中医上说的湿热现象，主要由湿热造成慢性腹泻，这种病人不怕冷，但怕热，出汗较多，腹股沟等容易生癣等，可以服用黄连素或甲硝唑。
f. 临床上还存在腹泻与便秘交替的现象，这也与内分泌有关，可以服用小建中颗粒，在腹泻时加吃布洛芬+补硒片，布洛芬每天3-4粒；在便秘时服用水苏糖或低聚果糖，这样治疗效果就会好很多。
g. 有原发性痛经或其他痛经的女性，如果经期腹泻严重，经血明显偏多，人偏胖，痛觉比较厉害，其实由内分泌疾病引起，可以服用布洛芬+补硒片+复合维生素B+钙铁锌片，即可消除疼痛和经血过多，又可治疗腹泻，效果不错。布洛芬的剂量为每天3-6粒，分2-3次服用，一般可以每天2次，每次2粒，其他按说明书服用，效果令人满意。
以上为慢性腹泻的一般治疗办法，有此问题的病人可仔细阅读，按症状考虑服用。慢性腹泻的病人通常还带有慢性胃炎，如浅表性胃炎等，经常会出现胃部翻江倒海式的不舒服，此时只要服用维生素A+维生素B12+维生素B9即可解决问题。这类慢性胃炎的病人通常长期缺少以上维生素，其肠道腹泻问题实际上的原因也相同，故通常可以胃肠一起治疗，通过长期补充这些维生素解决问题。有的病人还带有流鼻血症状，应当补充维生素B2+复合维生素B可以解决。有的带有脂溢性皮炎，即皮肤头发油性明显，需补充维生素B6+维生素B2+维生素E，这样症状会明显改善。