1999年
　　129 来自黑衣组织的女子 大学教授杀人事件★ B
　　130 竞技场无差别胁迫事件(上集)
　　131 竞技场无差别胁迫事件(下集)
　　132 魔术爱好者杀人事件(事件篇) K
　　133 魔术爱好者杀人事件(疑惑篇) K
　　134 魔术爱好者杀人事件(解决篇) K
　　135 消失的凶器搜索事件 ◆
　　136 青色古堡探索事件(上集)
　　137 青色古堡探索事件(下集)
　　138 最终播映杀人事件(上集)
　　139 最终播映杀人事件(下集)
　　140 SOS！步美传达的讯息◆
　　141 结婚前夕密室事件(上集)X
　　142 结婚前夕密室事件(下集)X
　　143 疑惑的天体观测 ◆
　　144 上野出发的北斗星3号(上集)
　　145 上野出发的北斗星3号(下集)
　　146 本厅刑事恋爱物语(上集)
　　147 本厅刑事恋爱物语(下集)
　　148 地上电车紧急煞车事件 ◆
　　149 游乐园高空弹跳事件 ◆
　　150 汽车爆炸事件的真相(上集)◆
　　151 汽车爆炸事件的真相(下集)◆
　　152 神秘老人失踪事件 ◆
　　153 园子的夏日海滩冒险物语(上集)
　　154 园子的夏日海滩冒险物语(下集)
　　155 水中的钥匙密室事件◆
　　156 本厅刑事恋爱物语2(上集)
　　157 本厅刑事恋爱物语2(下集) 
　　158 沉默的环状线 ◆
　　159 诡异的五重塔传说(上集)◆
　　160 诡异的五重塔传说(下集)◆
　　161 流过流水亭的杀机 ◆
　　162 飞天密室 工藤新一最初的事件★S
　　163 月亮、星星与太阳的秘密(上集)
　　164 月亮、星星与太阳的秘密(下集)
　　165 少年侦探队消失事件 ◆
　　166 鸟取县蜘蛛公馆的怪事(事件篇)X
　　167 鸟取县蜘蛛公馆的怪事(疑惑篇)X
　　168 鸟取县蜘蛛公馆的怪事(解决篇)X
　　169 维纳斯之吻 ◆
　　170 黑暗之中的死角(上集)
　　171 黑暗之中的死角(下集)
　　172 复活的死亡讯息(上集)
　　173 复活的死亡讯息(下集) 
2000年
　　174 二十年的杀意 圣佛尼号连续杀人事件★X
　　175 被杀了四次的男人 
　　176 与黑暗组织的再会(灰原篇) B
　　177 与黑暗组织的再会(柯南篇) B
　　178 与黑暗组织的再会(解决篇) B
　　179 咖啡厅卡车突然撞入事件 ◆
　　180 红色的杀机夜想曲(上集)◆
　　181 红色的杀机夜想曲(下集)◆
　　182 第九个门大搜查 ◆
　　183 危险的处方笺 ◆
　　184 诅咒的假面的冷笑★◆
　　185 被狙击的名侦探(上集)◆
　　186 被狙击的名侦探(下集)◆
　　187 在黑暗中传出的神秘枪声 ◆
　　188 危命的复活 洞窟内的侦探团 
　　189 危命的复活 负伤之下的名侦探 X
　　190 危命的复活 第三个选择 B/X/S
　　191 危命的复活 黑衣骑士 B/X/S
　　192 危命的复活 新一回来了X/S 
　　193 危命的复活 约定的场所S
　　194 别有玄机的八音盒(上集)
　　195 别有玄机的八音盒(下集)
　　196 看不见的凶器　小兰的初次推理 ◆
　　197 超级汽车陷阱(上集)◆
　　198 超级汽车陷阱(下集)◆
　　199 嫌疑犯˙毛利小五郎(上集)
　　200 嫌疑犯˙毛利小五郎(下集)
　　201 第10个乘客(上集)◆
　　202 第10个乘客(下集)◆
　　203 依卡路斯的黑色之翼(上集)◆
　　204 依卡路斯的黑色之翼(下集)◆
　　205 本厅刑事恋爱物语3(上集)
　　206 本厅刑事恋爱物语3(下集)
　　207 完美的名推理 ◆
　　208 迷宫的入口 巨大神像的愤怒★◆
　　209 龙神山坠车事件 ◆
　　210 五彩传说的水底龙宫(上集)◆
　　211 五彩传说的水底龙宫(下集)◆
　　212 松茸、熊与侦探队(上集)
　　213 松茸、熊与侦探队(下集)
　　214 怀古饭店的神秘事件◆
　　215 复仇海滩(上集)◆
　　216 复仇海滩(下集)◆
　　217 目暮尘封的秘密(上集)
　　218 目暮尘封的秘密(下集)