HXN5B液化天然气机车是本厂在HXN5B内燃机车的基础上做的清洁能源版。 液化天然气LNG作为一种清洁、高效、方便、安全的能源，以其热值高、污染少、储运方便等特点成为了现代社会人们可选择的优质能源之一。这批LNG版N5B外观造型不变，但是把油箱改成同样容积为8500升的天然气瓶，风笛采用HXN5同款的K5AL，并设在司机室和发动机舱之间凹陷处。
编号从HXN5B-6001起，未来将配属于广铁为主，用于替换广州站的DF10D调车内燃机车以及粤海铁路的DF4DD狗头车。

参数设置：
产量：240台
序列编号：6001~6240
轨距1435mm
传动型式交－直－交电传动
轴式C0－C0
轮径1250mm
轴重23t
计算整备重量138t
机车装车功率3750KW
机车速度最大速度120km/h，持续速度30km/h
机车轮周牵引力：最大起动牵引力560KN，持续牵引力540KN
通过最小曲线半径85m
天然气瓶容积8500L
本厂自研R16V300ZJ型LNG发动机：缸数16缸，缸径300mm，行程300mm，额定转速1000rpm，最低空载稳定转速330rpm，低工作转速400rpm，LNG消耗率:198L/kW.h，排放指标TierIV

批准

主要用途：调车和小运转交路。由于其构造速度提高到了120KM/H，因此也可以用于拉临客。

从HXN5B6000系液化天然气机车开始，本厂生产的内燃机车将全部使用包括LNG，地沟油等清洁能源作为燃料，有害物质排放减少60%—80%。即使功率手柄推到最大也不会冒出黑烟污染环境。

京局京段2台

HXN5B天然气机车增大了司机室玻璃面积，减小了前面鼻子部分的体积（应该是沙箱或电气箱），这一设计参考ND5二型，如图。