崇祯六年（1633年）四月，他们率叛军及家眷10000多人在鸭绿江口与济尔哈朗、阿济格、杜度率领的后金兵会合，被要求剃发，登莱之乱遂告结束。由于孔有德带来了后金急需的舰队、红夷大炮及匠人，所以皇太极对他们的投降极为重视，亲率诸贝勒出盛京十里迎接，并使用女真人最隆重的“抱见礼”相待，仍以他为都元帅，安置东京（辽阳），自成一军，称“天佑兵”，给予特殊待遇，随后便引后金兵攻占黄龙所在之旅顺。崇祯九年（1636年）大清帝国成立之际，孔有德受封恭顺王，并且作为汉官代表劝进。同年冬，孔有德等三顺王充当了清军的急先锋，带领6千清军攻打朝鲜，迫使朝鲜投降清朝，使明朝失去了可靠的邻国和在东面牵制清军南下的重要力量。在以后清朝对明战争中，孔有德也大多参与其中，立下汗马功劳