AP第二季，的剧情主要讲黑幕是天朝中央机关，暗中联合了伊科斯星人，准备将地球做为私有星球卖给伊科斯星人，地球人也全部做为奴隶卖给伊科斯星人。将神 州号派出去的真正目是为了开通新殖民星——白河星的道路，并想在那里建立空间传送站，可以在审判之日将地球上一部分“被选中人”送到新的星球去。这个计划 被称为《乐园》计划，并且只有地球部分高层人士知道。其中那个议会会长就知道这个计划。某次在议会会长和中央高层的通讯谈话中，被路过的紫晶听见，紫晶知 道了这个秘密后告诉了舰长。舰长让紫晶不要告诉其他人，并说会留意议会会长。但其实舰长和议会会长是一伙的，舰长便和议会会长一起设计要除掉紫晶。于是派 紫晶去参加苏亚星保卫战，并在途中调回了他的同伴。这场战役中，紫晶的机体被击坠，侥幸的紫晶只废了双腿，并没有死。但是在舰长的安排下，紫晶被隔离了起 来，这场战役之后紫晶再也没有见到过他的同伴。突然有一天莫连前来探病，但紫晶并不知道，这时候的莫连已经被议会会长植入了伊科星人研发的新病毒，唤醒了 第二个人格。莫连名义上是来探病其实是议会会长派来除掉紫晶的。最后紫晶死在了单人病房里。莫连也投奔了伊科斯星人。天龙这时候一直在担心紫晶的情况，因 为在苏亚星保卫战后一直没有见过紫晶，但是紫晶被莫连杀死的消息突然传来时，天龙彻底崩溃了，并再也没驾驶过战斗机。这时候在伊科星人那里的伊纱斯恢复了 记忆，并投奔了神州号，加入了天箭队并驾驶曾经是紫晶驾驶的4号机。将其涂装改为红色。伊纱斯见到了天龙后，兄妹重逢，在伊纱斯的鼓励下重新激起了天龙的 斗志。而另一方面木和队长在紫晶死后一直很疑惑，并调查紫晶的死因，最后在紫晶电脑中的留下笔记里知道了真正的黑幕。他想设法把这个消息告诉天龙，但是途 中遭到了议会会长的暗算，死于非命。天箭队在对抗伊科斯星人的同时，能否揭穿中央机关的黑幕吗？请看第二季吧。