城市轨道交通系统的运输计划包括以下几个方面:1. 路线规划和设计：包括选取轨道交通线路、站点、车站等方案的评估和决策。2. 运营管理：包括车辆调度、列车运行、维护保养等的管理和协调。3. 安全保障：通过安全措施、紧急应急预案和设施维护等手段，确保轨道交通运营的安全性。4. 客运服务：包括车票销售、站点服务、列车清洁等方面的服务。5. 财务管理：包括制定预算、资金筹措与管理、成本控制等方面的管理。6. 技术支持：包括技术研究、设备更新、数据采集和分析等方面的支持。