古生代的碳酸盐岩层中具有化石。因为古生代时期是植物、动物繁衍的历史阶段，而古生代的碳酸盐岩层形成于这一时期，他们保存了这一历史阶段的生物记录。它们在海底沉积，被多种碎屑和沉淀物填充，并且在适当的条件下经历了化学和物理环境的影响，形成了封闭的环境，从而保存古生物的形状。