根据上述基础思想，军人在武警医院做手术时，可能是由内蒙古医院的大夫进行操作，具体情况取决于医院的安排和协调。如果内蒙古自治区人民医院与武警医院之间有合作协议或者互通机制，那么在军人住院期间，内蒙医院大夫可能会参与治疗或操刀手术。但是具体的情况需要根据实际情况来确定，建议向相关医院咨询了解情况以获得更准确的信息。同时需要注意的是，即使是在没有正式合作关系的情况下，由于医疗资源的有限性以及医生的专业性和经验差异等原因，也可能会出现军队医护人员无法独立完成某些复杂手术的情况，此时可能需要借助外部医疗机构的技术支持来完成手术治疗。因此，在任何情况下都需要保持沟通和理解，以确保患者得到最好的医疗服务。