准备资料：首先，准备入驻申请所需的资料，包括企业营业执照、法定代表人身份证明、企业章程、企业银行账户等相关文件。
提交申请：将准备好的入驻申请资料提交给海口综合保税区的管理机构或相关部门。申请材料需要按照规定的格式和要求进行填写和整理。
审核和评估：管理机构对申请材料进行审核和评估，包括对企业的资质、经营范围、财务状况等入库进行审查，确保符合驻地条件和要求。
签订协议：如果申请通过审核，管理机构将与申请企业签订入住协议，明确双方的权益和责任，规定入住期限、使用面积、租金等相关事项。
缴纳费用：根据入驻协议的规定，企业需要及时缴纳相关费用，包括租金、服务费等。
办理手续：完成入驻协议备案和费用缴纳后，企业需按照管理机构的要求办理相关手续，包括在工商、税务等部门进行备案或注册。
配套完善：根据入驻需求，企业可能需要与管理机构或其他合作方沟通，进一步完善入驻所需的配套服务、设施或程序。
开展经营活动：完成上述流程后，企业即可在海口综合保税重新开展经营活动，享受相关政策和便利条件。
需要注意的是，具体的入驻流程可能因保税区管理机构的要求、政策规定等因素而有所不同，建议在具体操作前与相关管理机构进行咨询和沟通，确保了解最新的入驻要求和程序。