凌晨时段车票大多是候补的原因是因为12306平台将大部分的车票放在全程票上，因为全程票是铁路的利润来源和资源利用最大化的车票。等到发车前几天，大部分人已经抢到全程票了，因此很少有人购买全程票。剩余的车票会分配给区间站候补购买。这样做是为了让更多的人能够购买到实惠的车票，避免黄牛党一次性抢购完车票，同时也促进更多人使用12306平台。