不知道什么时候开始，柯南有了“主线”这种说法。网上好像一般是把黑暗组织出场的故事称为“主线”。但我并不怎么欣赏“主线”这种说法。我更愿意称之为“黑暗组织线”。
第一、柯南的故事主要内容是侦探（推理侦探或者物理侦探），与金田一相比，曾有“金田一重案（件），柯南重人（物描写）”的说法。黑暗组织的内容很少，和大部分故事没有关联。而且很多不涉及“黑暗组织线”的故事也都很精彩，而“黑暗组织线”的故事却未必精彩。
第二、初期动画中，甚至把黑暗组织的戏份删改了，把漫画里出场作案的琴酒改成了普通的黑衣人。73至少是默许了。一直到一百多集的“来自黑暗组织的女子”，琴酒才再度登场。这说明73在连载初期很可能只是把琴酒当一个把柯南变小的工具人而已，可删可改，可有可无。
第三、漫画、动画或者剧场版，琴酒等黑暗组织人物可以好几年都不登场，可见其根本算不上什么“驱动故事发展最主要的一条线”。对比一下，你能想象兰在动画中几年都不出场吗？能想象哪部剧场版没有新兰互动吗？
第四、黑暗组织对整个故事发展只能说是有一定的促进作用，但是称不称得上所谓的“主线”是很成问题的，从初期动画73至少是默许把黑暗组织的戏份删改了，就可以看出，琴酒最初不过就是个把工藤打晕变小的工具人。不管是动画还是剧场版，几年不出场都无大碍。从“工具”这一点来说，博士那些发明难道就对整个故事发展没作用？几乎每集都在用好吧？难道博士的发明可以称为“主线”？
第五、极端点甚至可以说，琴酒只在故事第一集和最后一集出场也是可以，而他在最后一集出场也只是为了交代下柯南如何变回来然后向兰告白而已。或者可以说，琴酒的作用有点像阻挠男女主角的恶毒女配……恶毒女配固然会给故事增加戏剧性，但恶毒女配本身称得上所谓的“主线”吗？
第六、柯南的故事，非要找一个“驱动故事发展最主要的一条线”出来的话，新兰的爱情线比起黑暗组织线，更有资格称为“主线”。相当大部分的漫画、动画，以及每部剧场版，必有新兰互动，且对于数量庞大的磕CP观众来说，新兰的爱情线就是故事最精彩的部分，在整个作品中定位也最最重要。而且工藤新一开篇也可以说是新兰约会，途中发生意外，然后柯南住进兰家里，接下来的故事也是以此为中心展开。怎么看新兰线都比黑暗组织线更有资格称为“主线”。要说“主线”，其实新兰才称得上“主线”。