巴氏灭菌法的现行方法
当今使用的巴氏灭菌法程序种类繁多。其中，“低温长时间”（LTLT）处理是一个间歇过程，如今只被小型乳品厂用来生产一些奶酪制品。“高温短时间”（HTST）处理是一个流动过程，通常在板式热交换器中进行，被广泛应用于饮用牛奶的生产。通过该方式获得的产品不是无菌的，即仍含有微生物，且在储存和处理的过程中需要冷藏。而“快速巴氏杀菌”主要应用于生产酸奶乳制品。
目前，国际上通用的巴氏高温消毒法主要有两种。
一种是将食品加热到62-65℃，保持30分钟。采用这一方法，可杀死食品中各种生长型致病菌，灭菌效率可达97.3%-99.9%，经消毒后残留的只是部分嗜热菌及耐热性菌以及芽孢等，这些细菌多数是乳酸菌，乳酸菌不但对人无害反而有益健康。
第二种方法将食品加热到75-90℃，保温15-16秒，其杀菌时间更短，工作效率更高。该方法杀菌的基本原则是能将病原菌杀死即可，但是温度太高反而会损失掉食品原有的营养成分。