在故事的开头，简单交代了主角雾雨小实的身份，24岁、生活在2021年、研究生、无业，有个名叫雾雨绘瑠奈的妹妹（已死），在14岁前一直能看见对方

雾雨小实的脑后有个不断扩大的肿包，并且似乎曾经和qb签订过契约，这些都是明显的伏笔

在一段因为喝咖啡导致了转场后，场景突然来到了雾雨小实讲自己关于认知革命（这同样是后文伏笔）的论文

但在这个过程中，雾雨绘瑠奈突然出现提问认知革命与魔法少女之间的关系，雾雨小实随即醒了过来，视角被拉回现实

原来前面的经历其实是梦境，雾雨小实因为之前摔倒而昏了过去，头也因此摔破了，但此时异样的事情发生，雾雨小实的头盖骨中并没有大脑

此时qb出现，一定程度上回溯了前面的伏笔，qb认为雾雨小实没有灵魂而无法签订契约，并由脑后肿瘤的qb同类型细胞来驱动思维

随后经过了一段非重要剧情，大概内容是雾雨小实身边出现了时空连续体崩溃，qb留下观察并直接住在了主角大脑空洞中，但在观察一段时间后准备离开，在这个过程中主角与qb进行交流得知脑中有一封信，将信拿出来开始阅读。
信中除了大量伏笔外，目前唯一有用的信息就是信沿虚线对折可以作为时间铁道的车票

在按照信上的说法做了之后，主角突然进入了一个正四面体迷宫，远方驶来了一辆蒸汽车，蒸汽车内部十分黑暗主角在看到几个人影后判断出对方是魔法少女，随后突然被对方用法杖敲晕

到这里第一段就结束了，剩下两段会在明后天更新
当然，这明显是个玩笑

雾雨小实醒来后，qb通过观测宇宙背景辐射认定现在是80万年后，此前击晕主角的少女被称为魔法人类，qb认为魔法人类自然进化到不需要契约就能成为魔法少女，且此处已经找不到其他qb，qb在与魔法人类的冲突中灭绝的可能性最高

有人可能要问了，这里为什么不使用常规翻译的进化魔法少女（进魔）或魔法少女人，原因主要有三：
1. homo magica直接翻译就是魔法人类
2.魔法人类会攻击一切无法建立关系的种族，包括魔法少女。
3.设定上魔法人类是智人被人际关系控制用于传播人际关系的下一阶段，翻译为魔法人类明显更为合理。

随后，在主角提问一下qb讲解了魔法人类如何避免魔女化
这段剧情大概的含义就是魔法人类通过更改外表，避免了人际关系产生的污秽，并且通过下载空间中的关系性来引发情绪产生感情能量，而魔法人类也无法和不能产生联系的物种交谈

在魔法人类的结界行走的过程中，天上突然掉下一颗陨石，陨石中出现了以科瓦尔为首的远古人类反抗军与魔法人类交织，科瓦尔在与主角交谈后得知主角来自过去立刻决定将主角接走，尽管战况不利，但两人还是成功逃脱。
科瓦尔希望雾雨小实制造非人类的魔法少女，认为可能通过这种方法来扭转战局，但这些非人智能没有人际关系，这个计划最终失败了。
那为什么非人智能没有人际关系？这也是后面的一个重要伏笔

在计划失败后，魔法人类最终将远古人类最后的定居点摧毁，绘瑠奈步步紧逼希望将小实拉入关系性中，但因为时间循环的能力会使生物的智力退化（见原文），小实通过计算出最好的行动路线冲入时间轨道，并直接将时间轨道的锅炉烧炸了