本作《幽蓝档案》大量的引用了「层(Layer)」这个名词。想必各位跳出碧蓝世界的牢师都已经明白了「层」的本质——
也就是次元壁，故事发生的世界与写作者存在的世界之间的分隔。
所有的幽蓝故事(不仅是幽蓝档案)都有着这个「层」的设定。包括上文提到的《咖啡馆的故事》一文里，天天摇天赋的圣骑士牢圣(由「真名已屏蔽」的他的设计者在层外操作)，以及短暂地跑进「层」里偷窥世界线分支的魔剑士牢刘，被幽默Silend从层外打了一发月牙天冲差点去世的牢静，都是「层」的体现。
(摇骰子还挺有意思的，我打算在幽蓝档案的十字神明篇玩一次)
在幽蓝档案中，一些妖魔鬼怪也会透过「层」将自己投射进去。例如《启程》中被爆破的某N社。还有未来会出现的很多奇怪东西。
例如「暗星」组织。我想各位牢师已经看出了它的真身罢(笑)