西秦衰亡的内因，主要是其国内民族矛盾和阶级矛盾的日趋尖锐。这些基本矛盾在西秦建弘七年(426)以前，并没有充分暴露出来。西秦是一个由乞伏部为主的部落联盟发展而来的政权，其统治的陇右地区，自秦汉以来就是一个多民族聚居的地区。因此，西秦统治下的民族极为复杂，主要有汉、羌、氐、鲜卑、休官、吐谷浑、屠各、丁零、卢水胡等。而每一个民族的社会状况又有所不同：有的是封建的坞堡，有的还处于原始社会末期部落或部落联盟的阶段；有的汉化较早，有的则僻远在山区，与外界接触不多。而这些民族大多是西秦乞伏氏统治者以武力征服的，它们的上层投靠西秦统治者，成为统治阶级的组成部分，然而广大的各族人民却深受西秦统治阶级的压迫和剥削。其中大多数人，都是统治者通过战争强迫迁徙至西秦境内，为统治阶级从事农牧业生产。这样，民族矛盾与阶级矛盾紧紧地交织在一起，一旦有了时机，就会像火山一样爆发出来，形成摧毁西秦政权的主要力量。西秦建弘七年，西秦在北凉、夏国的夹击下，损失惨重，各地被统治的民族则相继爆发反西秦统治者的斗争，如吐谷浑掘逵，陇西人辛澹，武始、洮阳的山羌，赤水城民，以及东羌乞提等。这些斗争，正是使西秦自盛转衰的主要内因。而这一主要的内因，又是通过外因，即北凉、夏、吐谷浑、仇池等多次进攻西秦，使之遭到失败，而发生作用的。

同时，西秦衰亡还有一些内因，如在乞伏乾归、炽磐统治时期，作为西秦统治者的乞伏氏还能够极力拉拢陇右等地汉族豪门和俊杰之士，建立以鲜卑为主联合汉族地主阶级的统治，故其统治基础较为巩固。可是慕末即位后，逐渐对汉族豪门、俊杰之士采取不信任的态度，其所重用的大臣中，汉族只有段晖、吉毗二人，这与乾归、炽磐重用汉族上层人士形成鲜明对照。更有甚者，慕末还因一些小事滥杀有势力的汉族豪门，如陇西辛进五族二十七人就惨遭杀害，造成了陇右汉族豪门大族离心的倾向。这一切无疑大大削弱了西秦的统治力量。又如，西秦最后一个统治者慕末，政刑酷滥，因弟轲殊罗按鲜卑旧俗烝父炽磐左夫人秃发氏，遂杀叔什寅及什寅母弟白养、去列等，以致众叛亲离；在夏军围南安时，乞伏氏族人先后投夏国。此外，西秦所据的陇右地区虽然较河湟地区开发早，但山地多，平原少，自然条件不如河西、关中，同时西秦社会生产力水平不高，经济实力本来就很薄弱，加上连年战争和自然灾害，国内用度不足，最终使其战争接连失败，内忧外患相继而来。慕末再也无法维持其统治，终于率部投归北魏。

至于西秦衰亡的外因是比较清楚的。在西秦后期，西边的北凉已兼并了西凉，占据了整个河西及新疆东部地区，成为西秦的劲敌；东面的夏国，虽遭到北魏的打击，势力日衰，但由于北魏的进逼，使之必然向西发展，与西秦争夺陇右。这对西秦来说，是十分危险的势力，而慕末君臣恰好对此估计不足。更为危险的是，北凉、夏国结成联盟，形成东西夹击之势，使西秦防不胜防，而最终丧师失地，加速了它的崩溃。此外，南边的吐谷浑国，自慕璝即位后，招纳秦、凉亡业之人，大力吸收汉族先进文化，势力增强。为了收复过去为西秦占据的领土和掳掠的人民，它死死咬住西秦不放，乘虚从南面进攻。当西秦君臣向陇西上邽迁徙后，吐谷浑立即占领了原西秦大部分领土，领有沙州、河州、秦州的大部分，凉州的一小部分。
综上所述，知西秦的衰亡绝不是偶然的。《魏书·乞伏国仁传》对西秦衰亡的原因作了概括的说明，云慕末时“政刑酷滥，内外崩离，部民多叛，人思乱矣”。其中也明确指出，西秦衰亡的根本原因还主要是内因，而西秦正是在“部民多叛，人思乱矣”的情况下，为夏国灭亡了。