1. 作用
· 增加样品密度:DNA 6×loading buffer(上样缓冲液)的主要成分包括甘油或蔗糖等物质。这些成分可以增加样品的密度,使得样品在点样后能够顺利地沉入到琼脂糖凝胶的加样孔底部。如果没有 loading buffer,DNA 样品的密度可能和电泳缓冲液相近,导致样品在加样孔中漂浮,不能很好地进入凝胶进行电泳分离。
· 指示电泳进程:loading buffer 中通常含有示踪染料,如溴酚蓝(bromophenol blue)和二甲苯青(xylene cyanol)。溴酚蓝在琼脂糖凝胶电泳中,其迁移速度大致相当于双链 DNA 片段大小为 300 - 400bp 的位置;二甲苯青的迁移速度稍慢,在琼脂糖凝胶中大致相当于 4 - 5kb 双链 DNA 的位置。通过观察这些染料的迁移情况,可以直观地判断电泳的进程,确定合适的电泳时间,避免 DNA 样品跑出凝胶而丢失。
· 稳定样品:它可以帮助维持 DNA 样品的稳定性,防止 DNA 在电泳过程中被核酸酶降解等情况的发生。同时,一定程度上保护 DNA 的结构,使其在电场作用下能够以相对稳定的状态进行迁移。
1. 使用方法
· 混合样品:将 DNA 样品与 6×loading buffer 按照一定比例混合。一般来说,DNA 样品体积与 6×loading buffer 体积之比为 5:1。例如,如果 DNA 样品体积是 10μL,那么需要加入 2μL 的 6×loading buffer,使最终的混合液中 loading buffer 的浓度达到 1×(因为是 6× 的原液,稀释后达到合适的工作浓度)。这样的比例可以保证上述作用的有效发挥,同时不会因为 loading buffer 过多而影响 DNA 样品的浓度和电泳结果。
· 点样:将混合好的样品小心地加入到琼脂糖凝胶的加样孔中。在加样过程中,要避免产生气泡,因为气泡可能会占据加样孔的空间,导致样品不能全部进入凝胶或者使样品的分布不均匀。可以使用微量移液器缓慢地将样品注入加样孔底部,使样品能够顺利地在凝胶中开始电泳。
· 电泳观察:在电泳过程中,观察示踪染料的迁移情况来判断电泳是否完成。当溴酚蓝或二甲苯青达到合适的位置(根据需要分离的 DNA 片段大小和实验目的确定),停止电泳,然后可以对凝胶进行后续的分析,如通过凝胶成像系统观察 DNA 条带等。
· 增加样品密度:DNA 6×loading buffer(上样缓冲液)的主要成分包括甘油或蔗糖等物质。这些成分可以增加样品的密度,使得样品在点样后能够顺利地沉入到琼脂糖凝胶的加样孔底部。如果没有 loading buffer,DNA 样品的密度可能和电泳缓冲液相近,导致样品在加样孔中漂浮,不能很好地进入凝胶进行电泳分离。
· 指示电泳进程:loading buffer 中通常含有示踪染料,如溴酚蓝(bromophenol blue)和二甲苯青(xylene cyanol)。溴酚蓝在琼脂糖凝胶电泳中,其迁移速度大致相当于双链 DNA 片段大小为 300 - 400bp 的位置;二甲苯青的迁移速度稍慢,在琼脂糖凝胶中大致相当于 4 - 5kb 双链 DNA 的位置。通过观察这些染料的迁移情况,可以直观地判断电泳的进程,确定合适的电泳时间,避免 DNA 样品跑出凝胶而丢失。
· 稳定样品:它可以帮助维持 DNA 样品的稳定性,防止 DNA 在电泳过程中被核酸酶降解等情况的发生。同时,一定程度上保护 DNA 的结构,使其在电场作用下能够以相对稳定的状态进行迁移。
1. 使用方法
· 混合样品:将 DNA 样品与 6×loading buffer 按照一定比例混合。一般来说,DNA 样品体积与 6×loading buffer 体积之比为 5:1。例如,如果 DNA 样品体积是 10μL,那么需要加入 2μL 的 6×loading buffer,使最终的混合液中 loading buffer 的浓度达到 1×(因为是 6× 的原液,稀释后达到合适的工作浓度)。这样的比例可以保证上述作用的有效发挥,同时不会因为 loading buffer 过多而影响 DNA 样品的浓度和电泳结果。
· 点样:将混合好的样品小心地加入到琼脂糖凝胶的加样孔中。在加样过程中,要避免产生气泡,因为气泡可能会占据加样孔的空间,导致样品不能全部进入凝胶或者使样品的分布不均匀。可以使用微量移液器缓慢地将样品注入加样孔底部,使样品能够顺利地在凝胶中开始电泳。
· 电泳观察:在电泳过程中,观察示踪染料的迁移情况来判断电泳是否完成。当溴酚蓝或二甲苯青达到合适的位置(根据需要分离的 DNA 片段大小和实验目的确定),停止电泳,然后可以对凝胶进行后续的分析,如通过凝胶成像系统观察 DNA 条带等。