成分
· TAE 缓冲液：由 Tris 碱、冰乙酸和乙二胺四乙酸（EDTA）组成。
· TBE 缓冲液：由 Tris 碱、硼酸和乙二胺四乙酸（EDTA）组成。
pH 值
· TAE 缓冲液：pH 值通常为 8.3 左右。
· TBE 缓冲液：pH 值一般为 8.0 左右。
缓冲能力
· TAE 缓冲液：缓冲容量相对较小，长时间电泳时，如过夜电泳，其缓冲能力可能不足以维持稳定的 pH 值，除非有循环装置使两极的缓冲液得到交换。
· TBE 缓冲液：具有较强的缓冲能力，能够在较长时间的电泳过程中更好地维持溶液 pH 的稳定，更适合长时间电泳。
对 DNA 迁移率的影响
· TAE 缓冲液：双链线状 DNA 在其中的迁移率较 TBE 缓冲液快约 10%，超螺旋在其中电泳时更符合实际相对分子质量，电泳大于 13kb 的片段时用 TAE 缓冲液将取得更好的分离效果。
· TBE 缓冲液：DNA 分子在其中的迁移速度相对较慢，但在分离小于 1kb 的 DNA 片段时，能够提供更高的分辨率，使条带更清晰。
与琼脂糖凝胶的相互作用
· TAE 缓冲液：与琼脂糖凝胶的相互作用较弱，不会产生明显的电渗作用，对 DNA 片段的回收率影响较小，常用于 DNA 片段的回收电泳。
TAE速溶颗粒
· TBE 缓冲液：易与琼脂糖相互作用生成非共价结合的四羟基硼酸盐复合物，造成高电渗作用，使 DNA 片段的回收率降低，因此不宜在回收电泳中使用。
对酶活性的影响
· TAE 缓冲液：对一些酶的抑制作用相对较小，如限制性内切酶等，更适合用于涉及这些酶的实验。
· TBE 缓冲液：其中的硼酸盐成分可能会对某些酶的活性产生一定的抑制作用，如 DNA 连接酶等，在进行涉及这些酶的后续实验时需要谨慎使用。
成本与制备
· TAE 缓冲液：成分相对简单，成本较低，制备也较为容易.
TBE 缓冲液：由于硼酸的成本相对较高，且在一些实验室中使用
· 频率相对较低，其制备成本可能会稍高，且获取的便捷性可能不如 TAE 缓冲液。
· TAE 缓冲液：由 Tris 碱、冰乙酸和乙二胺四乙酸（EDTA）组成。
· TBE 缓冲液：由 Tris 碱、硼酸和乙二胺四乙酸（EDTA）组成。
pH 值
· TAE 缓冲液：pH 值通常为 8.3 左右。
· TBE 缓冲液：pH 值一般为 8.0 左右。
缓冲能力
· TAE 缓冲液：缓冲容量相对较小，长时间电泳时，如过夜电泳，其缓冲能力可能不足以维持稳定的 pH 值，除非有循环装置使两极的缓冲液得到交换。
· TBE 缓冲液：具有较强的缓冲能力，能够在较长时间的电泳过程中更好地维持溶液 pH 的稳定，更适合长时间电泳。
对 DNA 迁移率的影响
· TAE 缓冲液：双链线状 DNA 在其中的迁移率较 TBE 缓冲液快约 10%，超螺旋在其中电泳时更符合实际相对分子质量，电泳大于 13kb 的片段时用 TAE 缓冲液将取得更好的分离效果。
· TBE 缓冲液：DNA 分子在其中的迁移速度相对较慢，但在分离小于 1kb 的 DNA 片段时，能够提供更高的分辨率，使条带更清晰。
与琼脂糖凝胶的相互作用
· TAE 缓冲液：与琼脂糖凝胶的相互作用较弱，不会产生明显的电渗作用，对 DNA 片段的回收率影响较小，常用于 DNA 片段的回收电泳。
TAE速溶颗粒
· TBE 缓冲液：易与琼脂糖相互作用生成非共价结合的四羟基硼酸盐复合物，造成高电渗作用，使 DNA 片段的回收率降低，因此不宜在回收电泳中使用。
对酶活性的影响
· TAE 缓冲液：对一些酶的抑制作用相对较小，如限制性内切酶等，更适合用于涉及这些酶的实验。
· TBE 缓冲液：其中的硼酸盐成分可能会对某些酶的活性产生一定的抑制作用，如 DNA 连接酶等，在进行涉及这些酶的后续实验时需要谨慎使用。
成本与制备
· TAE 缓冲液：成分相对简单，成本较低，制备也较为容易.
TBE 缓冲液：由于硼酸的成本相对较高，且在一些实验室中使用
· 频率相对较低，其制备成本可能会稍高，且获取的便捷性可能不如 TAE 缓冲液。
