首先是真人快打系列最早，一批拥有详细描写和设定的组织：林鬼。
“在中国东北的某个地方，存在着一个由刺客和盗贼组成的秘密部落，称为‘林鬼’。这个组织已经存在了几个世纪，并在为其服务付费的人们的邪恶意图下蓬勃发展。它的战士一出生就被选中，在远离文明日常运作的地方长大，并被剥夺了以前的生活。只有氏族知道它的存在。他们每个人都有一定的能力，使他们有别于正常人。这些技能代代相传，并在生活经历中磨练。某些林鬼武士拥有超自然能力，包括与自然沟通的能力。”
“林鬼禁止友谊，因为他们认为这是战士的缺陷，因此，他们只信任团体，而不信任个人。同样在同一系列中，想要离开氏族相当于叛国，可判处死刑。”
（以上为MK1前的简介，那个时候林鬼还是一个较为中立的雇佣杀手组织。当然，到了MK3情况急转直下）
该派别代表成员有：奎良（重启前为绝对零度）、避寒（重启前为前绝对零度和林鬼成员）、托马斯•弗巴塔（斯莫克，同时是LK-7T2紫色机械林鬼）、赛克特（LK-9T9，红色机械林鬼）、塞拉克斯（LK-4D4，黄色机械林鬼）、佛斯特（奎良的逆徒）

然后是很早有提及，但是设定一直含糊不清的白莲会（名字取材自现实中的白莲教，但是设定有很大差别）。
图一为MKX采用的新标志，图二为旧标志
“白莲会是由阳间永生守护者雷电和少林光明教派共同创立的，当时伟大空佬在真人快打中死于戈洛之手。由于巫师尚宗最终用一名来自异界的士兵击败了这位长期的冠军，阳间显然很容易受到攻击，不仅是来自本土敌人，还有来自异界的敌人。为此，雷神和僧侣们同意从阳间最优秀的战士中挑选一批冠军。这群人将毕生致力于学习和了解如何捍卫阳间独立，免受其他世界的威胁。
该组织的存在对未入会者保密，导致谣言在民众中传播。因此，许多人甚至不知道其他领域的存在，只知道光之秩序及其与地球领域的关系。
加入白莲会的信徒不必是光明教团的僧侣，而且对白莲教团的承诺也不是终身的。成员可以随时自愿退出，因此，白莲教团的人数从未为人所知，但据推测人数不多。白莲教团成员用白色头带相互识别，头带上印有佛教八瓣莲花的标志。他们的武术技能可以从本土或外国获得，但战士本身必须来自阳间。”
白莲会代表成员有：刘康、雷电、空佬、风神、空进

然后是在旧时间线被拳痴屠屠，后被半藏重建的白井流（该组织名称同样取材自现实真实存在的同名流派，但是仅仅只是取材自历史中的名称）。
该组织在四代之前一直都是没有正式定名的组织，属于是活在蝎子背景板的存在，直到四代同期的《真人快打神话：绝对零度》中才正式被定名为白井流，并首次正式讲述了关于拳痴、避寒、半藏以及两个组织之间相关故事桥段。
“白井流是多年前由林鬼武士武田创立的。武田最终厌倦了林鬼并离开了氏族。然而，离开氏族是会被处以死刑的，而武田则遭到了林鬼刺客的追杀。他离开中国，回到祖国日本，为领主和将军们服务。他的技艺逐渐传遍日本，并发展成为忍术。除了教授他的新技艺外，他还教授改良版的林鬼战术，并透露了许多他们的秘密。当武田的教诲在日本各地广为人知时，这进一步激怒了林鬼。他的追随者被称为白井流。
白井流和林鬼成为了巨大的对手。武田氏族通过穿着类似的黄色服装并教授他们自己的秘密的修改版本来嘲笑林鬼。虽然武田在晚年设法躲过了多次暗杀企图，但他最终还是被茶中的毒药杀死。没有人知道林鬼是否对他的死负有责任。在他死后，林鬼和白井流之间的仇恨仍在继续，因为白井流变得更加突出。”（注：毕竟故事里提到的武田与高桥武田不是同一个人，仅仅只是同名）
白井流代表成员有：波佐治半藏（蝎子，白井流宗师）、高桥武田（9代至11的替代时间线中为白井流的中忍以及半藏的徒弟）、奎良（重启后为新时间线蝎子，同时为白井流的联合创立者以及宗师）

在初代MK中就有提及的黑社会组织：黑龙会（名字取材自现实中日本曾经存在过的黑龙会）。
图一是MKX采用的新标志，图二是旧标志。
“据传说，黑龙会从其母组织红龙会中分离出来，由植芝盛平于 20 世纪上半叶创立。黑龙会成立的原因是人们对红龙会中盛行的严格的荣誉和隐秘准则根深蒂固的不满。”
黑龙会的代表成员是：卡诺（黑龙会现任领导者，按照旧时间线的日美混血设定应翻译为“加纳”，重启后为澳大利亚人）、卡巴尔（严格来说是黑龙会前成员，考虑到11中有登场还没有金盆洗手的卡巴尔，所以也算进去了）、崔魔（棕色忍者，掌握大地之力）、埃隆•布莱克（同样是黑龙会前成员，现为自由身，在异界干赏金猎人和雇佣兵）、基拉（其实这位比较冷门，考虑到一代的其中一位鬼面是她，也算有点话题度 ）、库巴（同样冷门，但一代的其中一位鬼面是他，所以就同样的理由 ）

黑龙会的母系派别，3D三部曲知名低走烂活：红龙会
“红龙氏族已经秘密存在了几个世纪，最初是由半神 戴刚在龙守护者卡罗的早期唤醒后创建的。该氏族迅速组建了一群人类追随者，由战士魔瓦多领导，成为一支技术精湛、纪律严明的战士队伍。然而，许多鲁莽的成员对他们被迫遭受的束缚以及红龙对他们施加的准则感到不满。因此，这个群体脱离了红龙，成立了自己的氏族，被称为黑龙。自那天起，除了戴刚的目标之外，母氏族的首要任务就是消灭异教徒团体。
红龙之王戴刚派出特工寻找并杀死了他的兄弟塔文。此外，他们还负责进行基因实验，将戴贡俘虏的监护人卡罗的 DNA 与红龙人类测试对象的 DNA 融合，使用蜥蜴 爬虫的遗传物质来帮助融合过程，创造出混血龙种族。
塔文最终在焦灼山脉找到了该氏族的据点，他在那里与被释放的卡罗一起消灭了红龙的队伍。所有剩余的红龙成员都在哈米吉多顿战役中丧生。”
红龙会代表成员：戴刚（冷门角色）、魔瓦多（冷门角色中稍微有点热门的角色，能够在MK1作为助战角色登场）、许浩（超级冷板凳，比杰瑞克还像卡诺的翻牌卡诺，主创都明确表示不喜欢的角色。十代漫画中被杀和11的埃隆•布莱克入场动画中只剩个头。一代Demo版本的茶馆场景的背景中有他的通缉令，但好像正式版中被去掉了）

在真人快打1首次登场的新组织，乌迦迪。
“Umgadi 是一支由女战士和女祭司组成的组织，她们是 Outworld 皇室的护卫，从 Outworld 的长女中挑选而出。被选中的 Umgadi 婴儿时期就被带离父母接受训练，长大后便与家人无缘。Umgadi 尊崇女神 Delia为自己的保护者。
辛黛尔皇后的长女美莲娜公主也被视为乌迦迪的一员，但与平民不同，她的贵族和王位继承人身份是公开的。”
（目前该派别因为登场较新，因此相关故事都还没展开）
代表成员有：塔尼亚（MK1版本）、李梅（MK1版本。前乌迦迪成员，现为巡捕房成员）、喀麦隆（MK1版本）

同样是非常早就有描写的组织：特种部队。
图一为MKX启用的新标志，图二为旧标志。
“特种部队最初在美国成立，名为美国特种部队，目标是制止国际犯罪团伙，特别是红龙和黑龙部族。到《真人快打：末日战场》时，该组织已成为地球特种部队；虽然它仍然是一个反犯罪组织，但其职责已扩大到保卫整个地球，抵御其他维度的入侵。
以特种部队为主角的游戏是PlayStation 的《真人快打：特种部队》 。黑龙的卡诺和杰瑞克是该组织的主要敌人。
外部世界调查局(OIA) 可以说是美国特种部队的继承者，因为美国特种部队的许多成员后来都加入了 OIA。OIA 后来成为地球特种部队。在遭到外部世界的袭击后，刀锋索尼娅说服她的特种部队军官们创建了OIA 。”
代表成员：刀锋索尼娅、贾克斯、乔尼•凯奇（MK X开始）、高桥剑痴（重启后为OIA成员）、凯西•凯奇（索尼娅和乔尼的女儿，快打少年团的头）、贾姬•布里吉斯（贾克斯的女儿，快打少年团之一，凯西的好朋友）

可汗护卫，异界可汗的贴身卫队团体。
代表成员：吉塔娜（前成员，没地方放了所以只能删掉公主的图）、美莲娜、杰德、蜥蜴人、巴拉卡、莫塔罗、艾尔马克、菲拉与托尔、令荒

在阴间建立的堕落古神辛诺克的追随者组织：暗影兄弟会（包括分支暗影姐妹会）
图一为MKX启用的新标志，图二为旧标志。
“暗影兄弟会是一个邪恶而狂热的邪教组织，以恶魔巫师拳痴为领导中心，崇拜堕落的古神 辛诺克。其无数成员一直在策划和计划将他从阴间释放出来。其标志是隐秘、秘密和欺骗，并涉及黑魔法和死灵法术。当拳痴能够获得将辛诺克从永恒监狱中释放出来的神圣护符时，他们实现了目标，在那里他已经控制了整个阴间。在真人快打4事件期间，在随后与吉塔娜公主、伊登人民、雷电及其地球战士的战争中，怒影赛波特和令荒等成员脱颖而出。
暗影兄弟会狂热宗教的核心在于这些恶魔般的狂热分子渴望有一天邪恶的古神辛诺克能够彻底从阴间黑暗的深渊中解脱出来，实现他的意志。他们会不惜一切代价实现他们阴险的乌托邦梦想，成为他们神圣的主人和创造者的得力助手，从而永远统治所有造物。”
代表成员：怒影赛波特（前绝对零度以及前林鬼成员避寒，黑色服装和皮肤的暗影杀手。拳痴死亡后成为了暗影兄弟会的最高领导）、拳痴（暗影兄弟会的创建者和实际掌控者，阴间的恶魔巫师。表面供奉辛诺克，实际背后有小算盘）、令荒（前暗影兄弟会成员，后随剧情发展更倾向异界可汗阵营）、萨莉娜（暗影兄弟会的分支暗影姐妹会成员，因避寒而萌生前往阳间和修为人形的想法。怒影赛波特在11中的镰刀实际原本是萨莉娜的）、塔尼亚（旧时间线为暗影姐妹会成员，表面身份是在异界外交大使中的卧底）、德•沃拉（虫族聚合体，科塔尔汗身边的假忠臣，暗影姐妹会秘密成员）、阿什拉（前暗影姐妹会成员，后脱离组织踏上除邪之路，以求化为人形）

就先发到这吧，剩下的组织要么没标志要么实在不出名，欢迎吧友们参与评价和讨论

火钳刘明

林鬼全员都喜欢，毕竟元素刺客确实帅，当时玩mk也是奔着零度去的

黑龙会的成员很多，真想了解去看mkx的官方漫画

反正简单贴一下吧。
外网Reddit经常有小投票。MK人气最高的不分组织肯定还是忍者类最受欢迎。零度蝎子一二轮流不用讲。烟，怒影，美莲吉塔双娜紧随其后。然后才轮到刘康和凯奇。
所以整体来看林鬼最占优势。人物多人气也高。
白井流吃亏经典人物少不过如果把武田这个Kombat Kids人气最高的也算上，应该是仅次于林鬼。
然后就是异星那一批了。人又多人气还高。像双娜人气很高，杰德，蜥蜴，巴拉卡也不低。
白莲会一般只能说，刘康虽然是主角但人气一直高不成低不就。雷电和空佬也是卡中上。而且主要是人少就这仨古董。
经典正面阵营人气整体最低的肯定是SF。虽然有凯奇和剑痴，但也不知道是怎么搞的索妮娅和老贾也算MK元老级别人物了，但人气就是贼低。甚至凯西都压过这俩。当然凯西本就是Kombat Kids人气第二。
黑龙会和后来的就算了。一个是小反派组织。还有整个3D时期人物人气就比较一般。