以下是回忆：
黑暗组织表面上曾必何时，是世上最庞大的贸易机构，影响力渗至各国军、政、经各阶层，其主宰者---路烈，更积极发展最尖端科技，收拢不少能人异士充实力量，以图完成自己征服世界的美梦。
    三天前，在这个炎热的一天，FBI和黑暗组织支部的激烈战斗刚刚开始。
    詹姆士、赤井秀一亲率大批FBI精英探员突击这个黑暗的支部，势要将其毁灭掉，更重要的目的是找寻被组织捕获的工藤新一。
    黑暗支部隐藏在一座大厦的地下，即是地下基地。
    可是再隐蔽的基地，也还是被FBI找到了，这还要归功于阿笠博士发明的追踪眼镜，找出了工藤新一的位置。并且不止FBI这一方，在这座大厦的不远处的另一座大厦顶端，一身白衣装束的家伙---怪盗KID正拿着望远镜观察着这边。“没想到跟踪FBI真的找到了他们的黑暗基地，真好运呢！”
     怪盗KID，其真实身份是高中生黑羽快斗。
    依然是一顶白色魔术帽，白色燕尾服，白色西装裤，华丽的单眼镜片，与每次出场
一样的装扮，看似与往常无异，但仔细观察便会发现，他锐利的眼神中多出了一丝仇恨的色彩.
    在前不久一段时间，黑羽快斗从他的父亲黑羽盗一的地下室中找到了一封父亲留给自己的亲笔信，经过多方面检测，发现没有问题，便打开信封，发现了惊人信息。
    原来快斗并非黑羽盗一的亲生儿子，而是其养子，自己的亲身父母竟是工藤优作夫妇，这也解释了为什么自己会和工藤新一如此相像，因为他们本就是亲兄弟（双生子）。
    信中还说明了快斗会成为黑羽盗一的养子。工藤优作和工藤有希子原本都是黑暗组织的高级成员，因无论在智力、武力上都与现任组织BOSS有得一拼，路烈担心他们会对自己的计划不利，便先发制人，想除掉眼中钉。工藤夫妇何其聪明的人物，岂会看不出路烈的阴谋，正好借这个机会脱离可恶的组织。由于工藤夫妇先一步洞穿了路烈的诡计，早就作好了万全之策，结果硬是在组织全力追捕下安然脱身，成为顺利脱离组织的首例（相比这下，第二对就没那么好运了，宫野厚司夫妇）。
    逃离组织后，工藤夫妇接下来的问题便是如何安置两个刚出生的双胞胎儿子，如果跟着他们定会遭到组织的残酷追杀。于是便有了这样的安排：工藤新一被放置在日本阿笠博士那里，而快斗则交给了自己的好友黑羽资盗一那里。
    得知自己的真正身世之后，快斗并不像一般人一样茫然不知所措，因为“月光下的魔术师”、“平成时代的亚森罗宾”有着不输于工藤新一的承受能力，他接受了自己的命运。
    黑羽盗一的死绝非意外，经过快斗的多方查访，终于得知事实真相：因第一代的怪盗的所作所为对黑暗组织的征服世界的计划有害无利，而被他们所暗杀。得知真相后，最张终结果当然是黑暗组织树立了除工藤新一、FBI以外的又一个强敌---黑羽快斗。亦是快斗眼中那一丝仇恨色彩的来源。
    FBI和黑暗支部的战斗已经进入了白热化阶段。
    虽然FBI在战斗前准备充分，人员充足，但黑暗支部占尽了位置优势，且其武器装备也不输于FBI，至使到现在FBI也无法攻进去。然尽管如此，仍会出现许多戏剧性的变化。
    朱迪：“可恶！黑暗支部的战力不弱，要攻进去很难啊！”朱迪观察出现在的形势后如是说。“不要轻进！”
    虽然这样说了，但总是有立功心切、不知死活的人前支自取灭亡。一名FBI探员进入了黑暗支部的猛烈攻击范围。
    无名探员：“黑暗组织的小兵有什么可怕的，看我来立此大功吧！”
    “这笨蛋！别走的太前啊！”有人喊他。但为时已晚，黑暗支部的枪弹已经纷纷向他招呼！